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百脉根NIN旁系同源蛋白的结构歧异和功能分化

ISSN号：1004-311X
期刊名称：生物技术
时间：2012.8.8
页码：41-46
分类：Q946[生物学—植物学]
作者机构：[1]南通大学生命科学学院
相关基金：江苏省高校自然科学基金项目(No.09KJB180006);国家自然科学基金项目(No.31000729)资助
相关项目：利用黄褐棉(Gossypium mustelinum) 导入系发掘利用其优异基因

中文摘要：

目的:研究百脉根(Lotus japonicus)NIN转录因子和它的旁系同源蛋白的结构歧异和功能分化。方法:从百脉根基因组中获取完全的NIN旁系同源蛋白质序列,通过生物信息学手段进行系统发育、理化性质、功能位点和蛋白质三级结构同源建模分析。结果:总共获得5个NIN旁系同源蛋白序列,其中2个属于新鉴别的成员,它们分属于两个不同的进化分支;脯氨酸含量在LjNLP3中比次高的LjNLP1增加33%,提示其具有耐旱的功能特征;功能位点分析显示NIN旁系同源蛋白之间存在差异,提示它们可能通过翻译后修饰发生了功能分化;LjNIN蛋白在进化过程中用一段α螺旋替代了LjNLP1的一段β折叠,这一差异可能导致百脉根Nin招募为根瘤感受基因。结论:初步揭示了百脉根NIN旁系同源蛋白的结构歧异与功能分化的关系,为进一步的实验研究奠定了基础。

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