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板栗实腐病菌rDNA-ITS 的RFLP和测序分析
  • ISSN号:1003-8981
  • 期刊名称:《经济林研究》
  • 时间:0
  • 分类:S664.2[农业科学—果树学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]湖北工程学院特色果蔬质量安全控制湖北省重点实验室,湖北孝感432000, [2]湖北工程学院生命科学技术学院,湖北孝感432000
  • 相关基金:国家自然科学基金(31200488);云南省应用基础研究计划(2011FB066);特色果蔬质量安全控制湖北省重点实验室开放基金(2013K02)。
中文摘要:

为了明确孝感本地板栗实腐病菌的种类及其多样性,对分离自孝感的11株板栗实腐病菌的ITS进行了测序和RFLP分析。用通用引物ITS4和ITS5扩增病原菌的ITS1-5.8S-ITS2区域,PCR扩增产物经EcoRⅠ、HaeⅢ和TaqⅠ分别酶切,酶切结果用软件NTSYSpc2.1作聚类图。经ITS-RFLP分析得到了11条多态性DNA条带,在遗传相似系数0.72水平分为4个类群。并对PCR产物进行测序和BLAST分析,相似序列用MEGA5.1构建系统发育树。经形态学和ITS双向测序和比对分析,病原菌主要来源于3个属:Botryosphaeria(无性态Diplodia)、Neofusicoccum和Fusarium(有性态Gibberella),其中Neofusicoccum为引起板栗实腐病菌的新报道属。

英文摘要:

To define species and diversity of Castanea mollissima seed rot pathogens in Xiaogan, ITS in 11 strains isolated from the local area were analyzed by sequencing and RFLP. The ITS1-5.8S-ITS2 region was amplified by universal primers ITS4 and ITS5. The products were digested by using EcoRⅠ, HaeⅢand TaqⅠrespectively, and the dendrogram was draw by NTSYSpc2.1 software. Total 11 polymorphic DNA brands are obtained through ITS-RFLP analysis, and the strains can be divided into four groups at 0.72 genetic similarity coefifcient. Furthermore, PCR productions were analyzed by sequencing and BLAST, and the phylogenetic tree of similar sequences was constructed by MEGA5.1. Based on morphology and ITS bidirectional sequencing, the pathogens mainly belong to three genus:Botryosphaeria (anamorph Diplodia), Neofusicoccum and Fusarium (teleomorph Gibberella), and Neofusicoccum is ifrstly reported in the disease.

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期刊信息
  • 《经济林研究》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:湖南省教育厅
  • 主办单位:中南林业科技大学
  • 主编:谭晓风
  • 地址:湖南省长沙市韶山南路498号中南林业科技大学期刊社
  • 邮编:410004
  • 邮箱:jjlyj-csfu@163.com
  • 电话:0731-5658526
  • 国际标准刊号:ISSN:1003-8981
  • 国内统一刊号:ISSN:43-1117/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:11076