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基于径向基神经网络的蛋白质二级结构预测
  • ISSN号:1002-8331
  • 期刊名称:《计算机工程与应用》
  • 时间:0
  • 分类:TP183[自动化与计算机技术—控制科学与工程;自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
  • 作者机构:[1]安徽建筑工业学院电子与信息工程学院,合肥230601, [2]中国科学技术大学自动化系,合肥230026, [3]中国科学院合肥智能机械研究所,合肥230031, [4]安徽大学电子信息工程学院,合肥230039
  • 相关基金:国家自然科学基金(the National Natural Science Foundation of China under Grant No.60875047);安徽省教育厅重大自然科学基金(No.ZD200906);安徽建筑工业学院青年科研基金(No.20104008).
中文摘要:

为提高蛋白质二级结构预测的精确度,提出并构建精确的径向基神经网络、广义回归神经网络,并基于5位编码和Profile编码,采用不同大小的滑动窗口,利用交叉检证法构建多个径向基网络预测器,分别对蛋白质二级结构进行预测,得到了较好的实验结果,其中aveQ3提高到70.96%。结果表明,径向基神经网络模型能有效提高预测精确度,也证明了实验方法的有效性和可行性。

英文摘要:

In order to improve the prediction accuracy of protein secondary structure, exact radial basis function neural network and generalized regression neural network are presented.Multi-radial basis network predictors are established based on 5 encoding, Profile encoding, different sliding windows and cross validation method.These predictors are used to predict protein secondary structure, and it gets preferable results.Thereinto, aveQ3 is improved to 70.96%.The results not only show radial basis network models can increase the prediction accuracy efficiently,but also prove the validity and feasibility of these motheds.

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期刊信息
  • 《计算机工程与应用》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:中国电子科技集团公司
  • 主办单位:华北计算技术研究所
  • 主编:怀进鹏
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  • 国际标准刊号:ISSN:1002-8331
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2127/TP
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  • 获奖情况:
  • 1. 2012年首批获得中国学术文献评价中心发布的 “...,2. 2001年获得新闻出版署“中国期刊方阵双效期刊”,3. 2008年首批入选国家科技部“中国精品科技期刊...,4.2003年-2011年连续获得工业和信息化部期刊最高...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
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