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猪嵴病毒和猪星状病毒及猪环曲病毒多重RT-PCR检测方法的建立及临床应用
  • ISSN号:1673-4696
  • 期刊名称:《中国兽医科学》
  • 时间:0
  • 分类:S852.659.6[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]四川农业大学动物生物技术中心, [2]四川农业大学动物疫病与人类健康四川省重点实验室, [3]四川农业大学食品学院,四川雅安625014, [4]自贡市大安区农牧林业局,四川自贡643000
  • 相关基金:教育部“长江学者和创新团队发展计划”创新团队项目(IRT13083);教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET11-1059)
中文摘要:

根据猪嵴病毒(PKV)3D基因、猪星状病毒(PAstV)ORF2基因和猪环曲病毒(PToV)M基因的序列,设计了3对引物,通过反应体系和条件的优化,首次建立了检测猪嵴病毒、猪星状病毒和猪环曲病毒的多重RT-PCR。本研究建立的多重RT-PCR对PKV、PAstV和PToV的最低检出限分别为1.51×10^4、1.19×10^3、1.26×10^4 copies/μL,同时也具有较强的特异性和良好的重复性。用该方法检测了40份来自四川省部分猪场的仔猪腹泻病样。结果显示,PKV、PAstV、PToV的阳性检出率分别为75.0%、30.0%和22.5%。与单一RT-PCR检测结果一致。本方法的建立对PKV、PAstV、PToV的鉴别诊断和混合感染检测具有重要的应用价值。

英文摘要:

Three pairs of primers were designed separately based on the published porcine kobuvirus (PKV) 3D gene,porcine astrovirus(PAstV) ORF2 gene and porcine torovirus(PToV) M gene sequences. Through the optimization of the reaction system and conditions, a multiplex reverse transcription polyme- rase chain reaction(multiplex RT-PCR) for detection of PKV,PAstV and PToV was developed for the first time. The lowest detection limits of PKV, PAstV and PToV were proved to be 1. 51 × 10^4 copies/μL, 1.19 × 10^3 copies/μL and 1.26 × 104 copies/μL respectively. And this multiplex RT-PCR method has high specificity and good repeatability. To evaluate the potential application of the multiplex RT-PCR assay for clinical diagnosis,40 samples from piglets with diarrhea in Sichuan Province were obtained and examined. The positive rate of PKV,PAstV and PToV were 75.0% ,30. 0% and 22.5% ,respectively. This result is consis- tent with the single RT-PCR. The results suggested that this method has the application value in diagnosis or differential diagnosis in PKV,PAstV and PToV mixed infection.

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期刊信息
  • 《中国兽医科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院兰州兽医研究所
  • 主编:殷宏
  • 地址:兰州市盐场堡徐家坪1号
  • 邮编:730046
  • 邮箱:zgsykx@zgsykx.com
  • 电话:0931-8310086 8342195
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-4696
  • 国内统一刊号:ISSN:62-1192/S
  • 邮发代号:54-33
  • 获奖情况:
  • 2003年获第二届国家期刊奖百种重点期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:6141