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HTCLOSE:快速挖掘微阵列数据集中的频繁闭合模式
  • ISSN号:1000-1220
  • 期刊名称:《小型微型计算机系统》
  • 时间:0
  • 分类:TP311[自动化与计算机技术—计算机软件与理论;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]中国科学技术大学计算机科学与技术系,安徽合肥230027, [2]桂林电子科技大学计算机系,广西桂林541004
  • 相关基金:国家自然科学基金重点项目(60533020)资助.
中文摘要:

由于微阵列数据集行(样本)少列(基因)多的特征,使得采用传统列枚举方法对其进行频繁闭合模式挖掘较为困难,基于行枚举方法,提出超链接结构HT-struct,并基于该结构提出频繁闭合模式挖掘新算法HTCLOSE,算法采用深度优先搜索策略,结合高效的修剪技术和巧妙的链表组织技术,在时间和空间上均得到了优化,实验表明,HTCLOSE算法通常快于行枚举算法CARPENTER。

英文摘要:

Because the microarray datasets contain a large number of columns (genes) and a small number of rows (samples), mining frequent closed patterns in microarray datasets pose a great challenge for traditional algorithms based on the column enumeration space. Based on the row enumeration space, a hyperlink structure,HT-struct was suggested and a new algorithm, HTCLOSE was proposed for mining frequent closed patterns. HTCLOSE searched the row enumeration space in depth-first, combined efficient pruning and ingenious hyperlink organizing. Several experiments on real-life microarray datasets showed that HTCLOSE was faster than CARPENTER, an algorithm based on the row enumeration space.

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期刊信息
  • 《小型微型计算机系统》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院沈阳计算技术研究所
  • 主编:林浒
  • 地址:沈阳市浑南新区南屏东路16号
  • 邮编:110168
  • 邮箱:xwjxt@sict.ac.cn
  • 电话:024-24696120 024-24696190-8870
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-1220
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1106/TP
  • 邮发代号:8-108
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,中国科学引文数据库来源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:23212