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DNA混合分析技术的单体型频率估计方法
  • 期刊名称:中南大学学报(医学版)
  • 时间:0
  • 页码:457-460
  • 语言:中文
  • 分类:R394[医药卫生—医学遗传学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]北京大学医学部公共卫生学院流行病与卫生统计学系、流行病学教育部重点实验室,北京100191
  • 相关基金:国家向然科学基金(30671807,30872173).This work was supported by the National Natural Sciences Foundation of China(30671807,30872173).
  • 相关项目:缺血性脑卒中与糖、脂代谢异常的遗传流行病学家系研究
中文摘要:

DNA混合分析技术的广泛使用,能够明显降低研究的工作量和成本,然而仍然有其自身局限,例如损失了大量个体遗传信息、测量误差较大等。为了尽量克服DNA混合分析技术的自身问题,其检测和分析方法在不断发展与完善。在单体型频率估计方面,基于最大期望(expectation-maximization,EM)算法的新方法不断涌现,如HaploPool算法和PoooL算法,其准确性、实用性均增强。

英文摘要:

DNA pooling,a fast and economic study strategy,is widely used in areas of scientific research.In spite of various limits,researchers are making their efforts to improve DNA pooling toward a more perfect direction,including allele frequency detection and estimation of haplotypes.In haplotype estimation,more and more analyzing methods originated from the expectation-maximization algorithm have appeared,with improved accuracy and practicality,such as HaploPool algorithm and PoooL algorithm.

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