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鸭腺病毒A型Hexon基因克隆与序列分析
  • ISSN号:1671-7236
  • 期刊名称:《中国畜牧兽医》
  • 时间:0
  • 分类:S852.65[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:福建省农业科学院畜牧兽医研究所、福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心、福建省禽病防治重点实验室,福州350013
  • 相关基金:国家水禽产业技术体系(CARS-43); 国家自然科学基金(31602068); 福建省农业科学院畜牧兽医研究所基金[MYQJ2015(S)-3]; 福建省自然科学基金(2015J01114); 福建省农业科学院“青年科技英才百人计划”专项(YC2015-12)
中文摘要:

为明确鸭腺病毒A型Hexon基因特征及其在腺病毒科病毒分类中的作用,本研究从前期分离鉴定的一株番鸭源鸭腺病毒A型分离株(JX2016株)中分段扩增获得其Hexon基因编码区。结果发现,鸭腺病毒A型JX2016株Hexon基因编码区为2 733 bp,编码910个氨基酸,与鸭腺病毒A型(FJ12025株)核苷酸同源性最高,达99.8%;与其他分离株Hexon基因核苷酸同源性均在99.4%以上;与鸭腺病毒2型(GR株,未明确分类地位)同源性仅为54.5%;与禽腺病毒A型Phelps株(鸡源)及P29株(鹅源)的核苷酸同源性分别为53.6%和55.2%。遗传进化树分析发现,所有鸭腺病毒A型分离株在遗传进化上均处于相同的亚分支,且与绵羊腺病毒D型(OAV287株)均处于富AT腺病毒属遗传进化分支。但鸭腺病毒2型(GR株)与禽腺病毒A型Phelps株(鸡源)、P29株(鹅源)却处于同一遗传进化分支,均属于禽腺病毒属遗传进化分支。基于Hexon蛋白的遗传进化分析,建议将鸭腺病毒A型重新命名为鸭源富AT腺病毒A型,将鸭腺病毒2型重新命名为鸭源禽腺病毒。

英文摘要:

In order to clarify the characteristics of the Hexon gene and the classification candidate of duck adenovirus A under the Adenoviridae family,the Hexon gene fragments of duck adenovirus A( designated as strain JX2016) were amplified. The results demonstrated that the cloned Hexon gene of duck adenovirus A( strain JX2016) was 2 733 bp in length,coding 910 amino acids. Nucleotide homology comparison showed that the strain JX2016 shared the highest nucleotide( 99. 8%) homology with reference strain FJ12025,also displayed higher than 99.4% nucleotide homology with other duck adenovirus A reference strains. However,the nucleotide homologies with strain GR( duck adenovirus 2,unclassified virus),Phelps( fowl adenovirus A) and P29( goose adenovirus) were 54.5%,53.6% and 55.2%,respectively.The genetic evolution analysis showed that all the duck adenovirus A strains were at the same subgroup,under the same Atadenovirus genus branch with ovine atadenovirus D( strain OAV287). Meanwhile,the duck adenovirus 2( strain GR) at the same branch under Aviadenovirus genus branch with fowl adenovirus A( strain Phelps) and goose adenovirus( strain P29). Based on the Hexon protein genetic evolutionanalysis,we suggested renamed the duck adenovirus A as duck-origin atadenovirus and renamed the duck adenovirus 2 as duck-origin aviadenovirus.

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期刊信息
  • 《中国畜牧兽医》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 主编:李琍
  • 地址:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:zgxmsy@caas.cn
  • 电话:010-62816020 62811226 62810371
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-7236
  • 国内统一刊号:ISSN:11-4843/S
  • 邮发代号:2-215
  • 获奖情况:
  • 1996年被农业部评为“95中国出版成就展”参展期刊...,1998年在首届全国畜牧兽医优秀科技期刊评比中总分...,2002年被中国期刊协会农业期刊分会和中国农学会评...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:22619