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西北部分地区苦马豆根瘤菌的遗传多样性
  • ISSN号:1005-0094
  • 期刊名称:《生物多样性》
  • 时间:0
  • 分类:Q943[生物学—植物学] S542.4[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]西北农林科技大学生命科学学院,陕西杨凌712100, [2]河西学院生命科学与工程系,甘肃张掖734000
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金(30670372)、科技部农业微生物菌种资源整理、整合及共享试点子项目(2005DKA21201)
中文摘要:

苦马豆(Sphaerophysa salsula)是荒漠区重要的豆科植物。为了研究其共生根瘤菌的多样性,本试验采用16S rDNA PCR-RFLP和16S rDNA全序列分析方法,对西北部分地区的苦马豆根瘤菌进行了遗传多样性及系统发育分析。结果表明,57株供试菌株共产生了9种遗传图谱类型,对每种图谱类型的代表性菌株进行16S rDNA全序列分析的结果表明,它们分别归属于中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)、根瘤菌属(Rhizobium)、中华根瘤菌属(Sinorhizobium)、土壤杆菌属(Agrobacterium)、叶杆菌属(Phyllobacterium)和Shinella kummerowiae。不同地域的菌株在多样性方面也有明显差异:分离自银川的苦马豆根瘤菌的Jaccard相似性系数较低;而来自民乐县和临泽县的菌株有着非常丰富的遗传多样性,其Simpson指数分别为0.826和0.710,Shannon-Wiener指数分别为1.831和1.530。以上结果为进一步确定西北地区豆科植物根瘤菌的系统分类地位提供了依据。

英文摘要:

Sphaerophysa salsula is a highly nutritive and drought-tolerant perennial grass distributed in mid-Asia and northwestern China. This legume plant is highly prized for the revegetation of drought and high alkali soils. Our objective was to better understand the diversity and phylogeny of rhizobia collected from nodules of Sphaerophsa salsula in different regions of northwestem China. We estimated genetic diversity using 16S rDNA PCR-RFLP and 16S rDNA sequencing. Nine genotypes were tested from 57 strains. 16S rDNA sequencing revealed that these rhizobial strains belonged to the following genera: Mesorhizobium, Rhizobium, Sinorhizobium, Agrobacterium, Phyllobacterium and Shinella kummerowiae. The Jaccard simi- larity coefficient of the strains from Yinchuan was low while the strains isolated from Minle and Linze had rich diversity, with Simpson indices of 0.826 and 0.710, respectively, and Shannon-Wiener indices of 1.831 and 1.530, respectively. This study provides basic information for the phylogeny of rhizobia in northwestern China.

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期刊信息
  • 《生物多样性》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院生物多样性委员会、中国植物学会、中国科学院植物研究所、中国科学院动物研究所、中国科学院微生物研究所
  • 主编:马克平
  • 地址:北京香山南辛村20号
  • 邮编:100093
  • 邮箱:biodiversity@ibcas.ac.cn
  • 电话:010-62836137
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-0094
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3247/Q
  • 邮发代号:82-858
  • 获奖情况:
  • 2000年获中国科学院优秀期刊三等奖,2006年"中国百种杰出学术期刊"称号,2007年"中国百种杰出学术期刊"称号,2008年度中国精品科技期刊,2008年度"中国科协精品科技期刊工程"B类项目资助,2008年"第六届中国科协期刊优秀学术论文"
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),瑞典开放获取期刊指南
  • 被引量:19480