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黄色粘球菌发育阶段外膜蛋白表达的变化
  • ISSN号:0253-2654
  • 期刊名称:《微生物学通报》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]东南大学医学院基础医学实验教学中心细胞分子实验室,江苏南京210009, [2]东南大学医学院生物化学系,江苏南京210009
  • 相关基金:National Natural Science Foundation of China(No.30571008)
中文摘要:

【目的】黄色粘球菌是研究原核发育的一种模式生物,对其膜蛋白的研究仍然十分缺乏。【方法】利用6种预测软件,在黄色粘球菌的基因组中筛选编码外膜蛋白(OMP)的基因。根据报告基因lacZ,检测这些基因在营养性生长和发育阶段的表达。【结果】基于生物信息学分析,筛选出11个编码外膜蛋白的基因。其中2个基因(MXAN3106和MXAN3883)在发育阶段表达量上升,它们分别编码Secretin家族和Fimbrial usher protein(FUP)家族转运蛋白。其余9个基因在发育起始阶段表达量降低或保持较低水平,它们均编码TonB依赖型受体或外排蛋白。【结论】这些数据提示,黄色粘球菌由生长到发育的转换过程,伴随着膜蛋白表达的显著变化。

英文摘要:

[Objective] The membrane proteins of Myxococcus xanthus, a model organism for studying prokaryotic development, remain an under-explored territory. [Methods] Putative outer membrane protein(OMP)-encoding ORFs were selected from Myxococcus xanthus genome using six computational algorithms. With lacZ as a reporter, we monitored the expression profiles of these genes during vegetative growth and development. [Results] Eleven putative OMPs have been identified based on bioinformatic analysis. Increased expression during development was found in two genes, MXAN3106 and MXAN3883, which were predicted to encode protein transporters of the secretin family and the fimbrial usher protein(FUP) family, respectively. The remaining nine genes that code for Ton B-dependent receptors or efflux proteins exhibited a decreased expression or remained at a very low expression level after initiation of development. [Conclusion] Our data suggest that for M. xanthus, switching from growth to development is associated with a dramatic change in the expression pattern of membrane proteins.

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期刊信息
  • 《微生物学通报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院微生物研究所 中国微生物学会
  • 主编:赫荣乔
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路一号院3号中国科学院微生物研究所内B401室
  • 邮编:100101
  • 邮箱:xuj@sun.im.ac.cn
  • 电话:010-64807511
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-2654
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1996/Q
  • 邮发代号:2-817
  • 获奖情况:
  • 1992年中国科学技术协会优秀学术期刊三等奖,1992年国家科委中共中央宣传部新闻出版署“全国优...,2000年中国科学院优秀期刊三等奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:29487