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基于DNA双链特征的启动子预测方法
  • ISSN号:1673-0291
  • 期刊名称:《北京交通大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:TP391[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]烟台大学计算机学院,山东烟台264005
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(60772028)
中文摘要:

真核启动子预测是DNA序列分析的重要问题之一.本文提出一个基于内容的新算法,考虑DNA的双链特征,特征的出现频率用位置权矩阵表示,利用boosting算法进行训练和预测,得出的结果与其他算法相比,有很好的敏感性和特异性.

英文摘要:

The prediction of Eukaryotic promoter is one of the most important problems in DNA sequence analysis. In this work, we develop a new algorithm which is based on word considering the double-stranded characteristics of DNA. The frequency of occurrence of characteristics is represented by positional weight matrix. The boosting algorithm is used to train and predict respectively. The results in the algorithms have better sensitivity and specificity than that of the other algorithms.

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期刊信息
  • 《北京交通大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:教育部
  • 主办单位:北京交通大学
  • 主编:孙守光
  • 地址:北京市西直门外上园村3号北方交通大学8楼8101室
  • 邮编:100044
  • 邮箱:bfxb@bjtu.edu.cn
  • 电话:010-51688053
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-0291
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5258/U
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 1995年铁道部科技期刊一等奖、1999年教育部组织的...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:5152