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细粒棘球绦虫Eg95抗原表位的生物信息学预测
  • ISSN号:1002-2694
  • 期刊名称:中国人兽共患病学报
  • 时间:2011.10.10
  • 页码:892-896+900
  • 分类:R383.3[医药卫生—医学寄生虫学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]新疆医科大学第一附属医院新疆重点实验室,乌鲁木齐830011, [2]新疆医科大学附属中医医院,乌鲁木齐830000, [3]新疆自治区人民医院,乌鲁木齐830000, [4]新疆医科大学基础医学院,乌鲁木齐830011
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30901374 81060135 30560146 30860263)资助
  • 相关项目:滤泡辅助性T细胞在细粒棘球蚴感染中的作用和机制研究
中文摘要:

目的应用软件和在线网络分析Eg95的蛋白二级结构,预测B细胞表位和T细胞表位,为确定和筛选优势表位,研制安全、高效的表位疫苗奠定基础。方法采用DNAStar软件和在线网站IEDB、SYFPEITHI等对Eg95的B细胞表位和T细胞表位进行预测。结果 Eg95存在潜在的抗原表位,B细胞表位区域:16-38,41-48,50-67,68-90,92-100,103-113,120-132。分值高的T细胞表位区域:6-14,14-22,48-56,4-12,98-106,142-150,146-154。结论运用生物信息学方法确定Eg95存在7个抗原表位,对进一步研究Eg95的抗原性和研发优势表位疫苗具有重要的意义。

英文摘要:

The protein secondary structure was analyzed by TMHMM Sever2.0 and SOPMA Sever,and B cell and T cell epitopes of Eg95 were predicted by DNAStar,IEDB and SYFPEITHI.Many distinct antigenic epitopes of Eg95 were identified by computation,and the possible B cell epitopes of which were in the regions of 16-38,41-48,50-67,68-90,92-100,103-113,and 120-132.The high score of T cell epitopes were in the regions of 6-14,14-22,48-56,4-12,98-106,142-150,and 146-154.These results indicated that there are 7 antigen epitopes in Eg95 antigen determined by bioinformatics methods,which are significant in the further research of Eg95 antigenic and development of dominant epitope vaccine.

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期刊信息
  • 《中国人兽共患病学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国微生物学会
  • 主编:严延生
  • 地址:福州市津泰路76号
  • 邮编:350001
  • 邮箱:rsghb@fjcdc.com.cn
  • 电话:0591-87552018
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-2694
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1284/R
  • 邮发代号:34-46
  • 获奖情况:
  • 中国基础医学核心期刊,中国生物医学核心期刊,中国科学引文数据库列为来源期刊及统计源,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:9000