位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
番茄CONSTANS类似基因的克隆与表达分析
  • ISSN号:0513-353X
  • 期刊名称:《园艺学报》
  • 时间:0
  • 分类:S641.2[农业科学—蔬菜学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]首都师范大学生命科学学院,北京100037, [2]中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30571274,30771474);农业部园艺作物遗传改良重点开放实验室项目
中文摘要:

以一个受生物钟调节的番茄转录衍生片段(transcription-drived fragment,TDF)为信息探针,通过在NCBI EST数据库中进行电子延伸和RT—PCR验证,获得了番茄CO类似基因的cDNA全长序列,命名为SlCO1(GenBank登录号,EU636698)。SlCO1蛋白含有386个氨基酸,氨基端存在两个B—box型锌指结构,羧基端含有一个TFC结构域。SlCO1蛋白与CO类蛋白的氨基酸一致性为34%-46%,但在B—box锌指和CCT结构域处高度保守。基因组序列包含1个535bp的内含子,位于B—box锌指和CCT结构域之间。表达谱分析表明,SlCO1在叶片中优势表达,在根和茎中表达较弱。SlCO1的克隆为了解CO类似基因在番茄开花中的作用奠定了基础。

英文摘要:

Derived from tomato and influenced by circadian clock, a transcription-drived fragment (TDF) was used as a seed sequence for searching homologous ESTs through electronical elongation in NCBI database. A full-length CONSTANS-like gene designed as SlCO1 (GenBank accession number, EU636698 ) , is cloned using RT-PCR. The deduced SlCO1 protein consisting of 386 amino acid residues contains two B-box zinc finger motifs near the amino terminus and a conserved CCT domain near the carboxy terminus. Moreover, a 535 bp intron is located between the B-box and CCT domain. Although SlCO1 proteins shares 34% -46% identity with other CO proteins, the deduced amino acid sequence is highly conserved in the B-box and CCT domain. SlCO1 expresses specifically and strongly in leaf, but weakly in root and stem. Cloning of SlCO1 will provide a scientific basis for understanding the role of CONSTANS-likc genes in tomato flowering process.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《园艺学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国园艺学会
  • 主编:杜永臣
  • 地址:北京市中关村南大街12号
  • 邮编:100081
  • 邮箱:ivfyyxb@mail.caas.net.cn
  • 电话:010-68919523
  • 国际标准刊号:ISSN:0513-353X
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1924/S
  • 邮发代号:82-471
  • 获奖情况:
  • 第一届全国优秀期刊奖,中国科协第三届优秀期刊奖,第二届国家期刊奖提名奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:43371