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蛋白质组学技术筛选与鉴定鲤鱼嗅脑急性创伤后的应激蛋白质
  • ISSN号:0253-3820
  • 期刊名称:《分析化学》
  • 时间:0
  • 分类:Q51[生物学—生物化学] S858.31[农业科学—临床兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]厦门大学生命科学学院细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室, [2]化学化工学院固体表面物理化学国家重点实验室, [3]化学生物学福建省重点实验室,厦门361005, [4]香港浸会大学化学系,香港
  • 相关基金:本文系国家自然科学基金(No.40776060)和厦门大学预研基金(No.xdkicx20051009)资助项目.
中文摘要:

优化建立鲤鱼(cyprinus carpio,CC)嗅觉端脑(嗅脑)全蛋白提取技术。联用低渗透裂解和液氮冻溶法破碎鲤鱼嗅脑组织(rhinencephalon tissue of cyprinus carpio,CCRT)、低速离心提取CCRT全蛋白,并采用双向凝胶电泳(2D-PAGE)技术进行有效分离。经分析与统计,每张CCRT的2D-PAGE图谱中的蛋白质斑点数目约为1200个。分别分离CCRT的脂溶性和水溶性全蛋白,并获得高分辨率的2D-PAGE图谱。选用差异蛋白质组学技术筛选经10%冰醋酸创伤后的CC,其端脑组织所表达出的6种应激蛋白质,并用肽质量指纹谱(peptide mass fingerprinting,PMF)和数据库检索技术给予鉴定。其中3种蛋白质为70S热休克蛋白、β微管蛋白和DNA链接酶IV,有望作为研究大脑急性创伤后的应激修复途径和机理的指示蛋白质。

英文摘要:

A combined available approach of low osmosis and freeze-soluble with liquid nitrogen was employed to disrupt the rhonencephalon tissue of Cyprinus carpio(CC). A centrifugal method with low speed was used to extract proteins in rhinencephalon tissue of CC (CCRT), and high-resolution 2D-PAGE map with 1200 protein spots was obtained. In this study, several techniques were employed for extracting and separating proteome in CCRT. Three lysis solutions were prepared to disrupt the tissue in the fish, and used to extract proteom, water-soluble proteins and fat-soluble proteins, respectively. Both fat-soluble and water-soluble proteins from the CCRT were effectively separated by an optimized 2D-PAGE method with high resolution. With treating by 10% acetic acid, six acute proteins in CCRT were selected by proteomic techniques, and further identified by peptide mass fingerprinting (PMF) and database research, respectively. Three of these differen- tial proteins can be primarily defined to be 70 kD heat-shock protein, DNA ligase IV, and β 5 tubulin. It was proposed that these proteins may be used as markers to study the repairing pathway and mechanism in brain once wounded.

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期刊信息
  • 《分析化学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国化学会 中国科学院长春应用化学研究所
  • 主编:杨秀荣
  • 地址:长春市人民大街5625号
  • 邮编:130022
  • 邮箱:fxhx@ciac.ac.cn
  • 电话:0431-85262017
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-3820
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1125/O6
  • 邮发代号:12-6
  • 获奖情况:
  • 1999获首届国家期刊奖,2000年获中国科学院优秀期刊特别奖,2001年入选中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国乌利希期刊指南,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:52455