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油茶总RNA的提取与内参基因的初选
  • ISSN号:1003-8981
  • 期刊名称:《经济林研究》
  • 时间:0
  • 分类:S603.2[农业科学—园艺学] S794.4[农业科学—林木遗传育种;农业科学—林学]
  • 作者机构:[1]中南林业科技大学经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室,湖南长沙410004, [2]中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,湖南长沙410004, [3]中南林业科技大学经济林培育与利用湖南省2011协同创新中心,湖南长沙410004, [4]康涅狄格大学植物科学与园林建筑系,美国康涅狄格州斯托尔斯06269
  • 相关基金:国家林业局“948”项目(2012-4-42);国家自然科学基金项目(31100497);教育部重点项目(212126);湖南省教育厅优秀青年项目(11B131)。
中文摘要:

为得到高质量的油茶总RNA及稳定的内参基因,以油茶良种‘华硕’为试验材料,采用ambion试剂盒结合CTAB法进行总RNA提取。获得的总RNA完整性好,纯度高;从前期构建的油茶转录组数据中选取ACT(肌动蛋白基因)等14个基因作为候选内参基因,共设计22对引物,通过RT-PCR反应体系的优化及琼脂糖凝胶电泳检测,快速筛选出了适合油茶不同组织(器官)的内参基因。ALB(清蛋白基因),EF1α(延伸因子基因),ETIF3H(启动因子基因),UBC2(泛素结合酶基因)可以作为油茶果实初选内参基因,EF1α可以作为油茶根、茎、花及果实内参基因,ETIF3H可以作为油茶根、茎、叶、花瓣的内参基因。

英文摘要:

In order to obtain high quality total RNA and stable reference genes in Camellia oleifera, taking ifne cultivar‘Huashuo’ as materials, total RNA was extracted by a combination of ambion kit and CTAB method. The obtained total RNA has good integrity and high purity. A total of 14 genes were selected as candidates of reference genes based on the previously constructed transcriptome data in C. oleifera, and 22 primers were designed for the 14 genes. The reference genes suitable for different tissues or organs were rapidly screened out by RT-PCR reaction system optimization and agarose gel electrophoresis detection. ALB (albumin gene), EF1α (elongation factor gene), ETIF3H (eukaryotic translation initiation gene), UBC2 (ubiquitin-conjugating enzyme gene) can be used as the reference genes for fruits, EF1αcan be used as a reference gene for root, stem, lfower and fruit, and ETIF3H can be used as a reliable reference gene for root, stem, leaf and fruit in C. oleifera.

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期刊信息
  • 《经济林研究》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:湖南省教育厅
  • 主办单位:中南林业科技大学
  • 主编:谭晓风
  • 地址:湖南省长沙市韶山南路498号中南林业科技大学期刊社
  • 邮编:410004
  • 邮箱:jjlyj-csfu@163.com
  • 电话:0731-5658526
  • 国际标准刊号:ISSN:1003-8981
  • 国内统一刊号:ISSN:43-1117/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:11076