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药物发现中常用化合物库特征描述与对比分析
  • ISSN号:1000-6818
  • 期刊名称:《物理化学学报》
  • 时间:0
  • 分类:O641[理学—物理化学;理学—化学] R914.2[医药卫生—药物化学;医药卫生—药学]
  • 作者机构:[1]北京大学药学院,北京大学天然药物及仿生药物国家重点实验室,北京100191, [2]北京大学理论生物学中心,北京100871, [3]中国医学科学院/北京协和医学院药用植物研究所,北京100094
  • 相关基金:国家高技术研究发展计划(863)(2012AA020308); 国家自然科学基金(20972010)资助项目
中文摘要:

随着计算技术的发展和分子模拟软件的日趋成熟,虚拟筛选已经在药物发现过程中发挥着越来越重要的作用.在虚拟筛选过程中,所使用化合物库的质量对先导化合物发现的成功率起着至关重要的作用.本文通过对已知药物库、天然产物库、中药原植物化学成分库、筛选常用商业化合物库以及研究者所在实验室建立的化合物库的分析比较,从化合物库的分子多样性、化学空间和分子骨架等多个方面提取并对比每一种化合物库的特征,发现了已知药物库与中药原植物化学成分库的特征相似性,揭示了中药原植物化学成分库作为筛选库的类药性优势,并且深化了对几种筛选用化合物库特征的认识和理解.

英文摘要:

With the development of computer technology and software for molecular modeling,virtual screening plays an important role in drug discovery.In the flow of virtual screening,high quality compound libraries used are essential for success.In this paper,we analyzed two known drug libraries,a natural product library,compounds from plants used for traditional Chinese medicines (TCM),two frequently used commercial libraries,and a compound library in home.Features of these libraries were extracted and compared for molecular diversity,chemical space,and molecular scaffolds.We found similarities between drugs and the compounds used for TCM,which indicates TCM could be useful for virtual screening.These results aid understand of the chemical characteristics used in virtual screening libraries.

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期刊信息
  • 《物理化学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:北京大学化学与分子工程学院承办
  • 主编:刘忠范
  • 地址:北京大学化学楼
  • 邮编:100871
  • 邮箱:whxb@pku.edu.cn
  • 电话:010-62751724
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-6818
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1892/O6
  • 邮发代号:82-163
  • 获奖情况:
  • 中文核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国科学引文索引(扩展库),英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:24781