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DNA序列的3D图形表示
  • ISSN号:2095-6134
  • 期刊名称:《中国科学院大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q751[生物学—分子生物学] O151.24[理学—数学;理学—基础数学]
  • 作者机构:[1]中国科学院研究生院数学科学学院,北京100049
  • 相关基金:was supported by NSFC (10671204)
中文摘要:

介绍一种新的DNA序列的3维图形表示,它可以避免相应空间图形的交叉和重叠.该图形表示的好处还在于,它仅仅有2种需要计算的可能情况,而在其它的3维表示中,往往有3种需要计算的情况.究其应用,我们对2种可能产生的表示情况,通过计算12种不同物种间编码序列对应的L/L矩阵产生的正规特征值,构造一个2-维向量来检测上述物种间的相似性与非相似性.

英文摘要:

We outline a novel 3D cal representation of DNA sequences, which can avoid crossing and overlapping of the corresponding spatial curve. And the advantage is that we can just consider two different conditions, in contrast with three conditions in other 3D representations. For the purpose of application, we construct a 2-component vector whose components are the normalized leading eigenvalues of the L/L matrices associated with DNA sequence based on the two conditions, to examine the similarities/dissimilarities among the coding sequences of different species.

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  • 《中国科学院大学学报》
  • 中国科技核心期刊
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  • 主编:石耀霖
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  • 国际标准刊号:ISSN:2095-6134
  • 国内统一刊号:ISSN:10-1131/N
  • 邮发代号:82-583
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  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
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