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代谢网络的蝴蝶结结构特征及其功能意义
  • ISSN号：0023-074X
  • 期刊名称：《科学通报》
  • 时间：0
  • 分类：O157.5[理学—数学;理学—基础数学]
  • 作者机构：[1]上海交通大学生命科学技术学院,上海200240, [2]上海生物信息技术研究中心,上海200235, [3]中国科学院上海生命科学研究院,上海200031, [4]重庆后勤工程学院数学教研室,重庆400016
  • 相关基金：国家科技攻关计划（编号：2003CB715900,2004CB720103）、国家自然科学基金项目（批准号：30500107,30670953）和上海市科学技术委员会科研计划（批准号：04DZ19850,04DZ14005）项目资助.致谢 感谢Ma H W和Zeng A P提供的代谢网络数据库.
作者： 赵静[1,2,4], 陶林[2], 俞鸿[2], 骆建华[1], 曹志伟[2], 李亦学[1,2,3]
关键词： 生物信息学, 代谢网络, 蝴蝶结结构, 随机网络
中文摘要：

研究全基因组代谢网络的结构拓扑对于了解结构与功能间的联系是必不可少的．而可视化有助于获取网络组织结构的直观信息．从网络拓扑的角度考察了75个物种的全基因组代谢网络．提出了一个展开蝴蝶结模型，实现了对代谢网络的蝴蝶结结构的清晰的可视化．展开蝴蝶结所揭示的代谢网络的结构特征，有助于我们设计高效的且更能反应代谢网络自身特点的网络算法．同时，这个粗粒化的网络模型还可实现对网络中脆弱连接的可视化，因此对于疾病研究和药靶发现都有潜在意义．通过对蝴蝶结中心部分的双向连接及主核的研究表明，代谢网络的蝴蝶结结构有其内在的、有意义的拓扑特征，而这些特征是随机网络所不具备的．

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期刊信息
  • 《科学通报》
  • 北大核心期刊（2011版）
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院
  • 主编：周光召
  • 地址：北京东黄城根北街16号
  • 邮编：100717
  • 邮箱：csb@scichina.org
  • 电话：010-64036120 64012686
  • 国际标准刊号：ISSN：0023-074X
  • 国内统一刊号：ISSN：11-1784/N
  • 邮发代号:80-213
  • 获奖情况:
  • 首届国家期刊奖,中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘（网络版）,美国数学评论（网络版）,美国工程索引,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊（2004版）,中国北大核心期刊（2008版）,中国北大核心期刊（2011版）,中国北大核心期刊（2014版）,中国北大核心期刊（2000版）
  • 被引量:81792