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水稻基因OsAFC2参与mRNA可变剪切调控
  • ISSN号:1008-0864
  • 期刊名称:《中国农业科技导报》
  • 分类:Q786[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:中国农业科学院生物技术研究所,北京100081
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31271801)资助.
中文摘要:

mRNA的可变剪切受到SR蛋白磷酸化水平的精确调控,AFC2作为SR蛋白激酶,能够影响mRNA可变剪切。在水稻RNAi突变体库中发现一个OsAFC2基因沉默突变体,进一步研究显示该基因定位于细胞核内,在水稻的各个组织部位均有表达,其中在叶片中表达量较高,在茎中表达量较低。与对照相比,在OsAFC2抑制表达的植株中,检测到的可变剪切数量明显增加,表明OsAFC2参与水稻细胞核中mRNA可变剪切的调控。

英文摘要:

AFC2 plays an important role in the regulation of mRNA alternative splicing by phosphylating SR proteins. Up to now, the regulatory function of rice AFC2 has not been analyzed. In this study, a mutant of OsAFC2 gene was obtained by screening rice RNAi library. Further studies showed that OsAFC2 located in the nucleus and expressed in the rice various tissue, of which, OsAFC2 was highly expressed in rice leaves and low expressed in rice stem. Compared with the wild type control, the expression of OsAFC2 was obviously downregulated in the RNAi mutant and upregulated in overexpression plants. RNA-seq analysis found that the number of the alternative splicing transcripts significantly increased in OsAFC2 RNAi plants, indicating OsAFC2 involved in the regulation of mRNA alternative splicing in the nucleus.

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期刊信息
  • 《中国农业科技导报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:科学技术部
  • 主办单位:中国农村技术开发中心
  • 主编:范云六
  • 地址:北京市海淀区中关村南大街12号中国农业科学院生物技术研究所
  • 邮编:100081
  • 邮箱:nykjdb@163.com
  • 电话:010-82106118
  • 国际标准刊号:ISSN:1008-0864
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3900/S
  • 邮发代号:82-245
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:12485