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FRG4基因全长克隆及生物信息学分析
  • ISSN号:1007-3949
  • 期刊名称:《中国动脉硬化杂志》
  • 时间:0
  • 分类:Q81[生物学—生物工程]
  • 作者机构:[1]南华大学病理生理学教研室,湖南省衡阳市421001, [2]南华大学心血管病研究所动脉硬化学湖南省重点实验室,湖南省衡阳市421001
  • 相关基金:国家自然科学基金(30570766,30470693)、湖南省教育厅重点科研项目(05A043)、湖南省教育厅基金(08C747)、动脉硬化学湖南省高校科技创新团队资助项目(湘教通[2008]244)和南华大学归国留学人员科研启动基金
中文摘要:

为了对新的人突触相关蛋白FRCA进行全长克隆及生物信息学分析,从人胎肝文库PCR扩增FRCA基因全长cDNA序列,用生物信息学方法对FRG4基因进行基因组结构分析、多序列同源性比较、跨膜区段、亲疏水性分析、功能结构域预测等。结果表明cDNA文库基础上运用热启动PCR获得FRCA全长cDNA序列,生物信息学分析显示FRCA基因与人类的突触相关蛋白有99%同源性;定位在X染色体的短臂2区2带2亚带2次亚带;由9个外显子和8个内含子组成;无跨膜区段;有一结构域BSD;该基因编码蛋白可能为一水溶性蛋白。

英文摘要:

To analyze the basic character of a novel Homosapiens synapse associated protein gene ( FRG4 ) with bioinformatics. FRG4 full-length sequence was obtained by hot-start PCR from human fetal liver library and its genomie constitution, the multi-sequences homology, the transmembrane domains, hydrophilicity and hydrophobicity, as well as its functional and structural domains were analyzed and predicted by bioinformatics. We have successfully attained the fulllength cDNA sequence of FRG4, bioinformatic analysis shows FRG4 gene has 99% homology with Homosapiens synapse associated protein 1 ( SYAP1 ), consists of 9 exons and 8 introns and located in Xp22.2. None transmembrane domains bat a BSD domain was discovered, and its encoding protein is probably a water-solubility protein.

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期刊信息
  • 《中国动脉硬化杂志》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国病理生理学会
  • 主编:姜志胜
  • 地址:湖南省衡阳市南华大学内
  • 邮编:421001
  • 邮箱:dmzzbjb@163.net
  • 电话:0734-8160765
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-3949
  • 国内统一刊号:ISSN:43-1262/R
  • 邮发代号:42-165
  • 获奖情况:
  • 中国科学技术论文统计源期刊,中国科学引文数据库来源期刊,中国学术期刊综合评价数据库来源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:17016