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应用ABEEMσπ方法计算多肽及蛋白质的分子电负性
  • ISSN号:1674-1404
  • 期刊名称:《大连工业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:TS201.2[轻工技术与工程—食品科学;轻工技术与工程—食品科学与工程] O641.12[理学—物理化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]辽宁师范大学化学化工学院,辽宁大连116029
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(21133005)
中文摘要:

应用ABEEMσπ方法计算了几种中性二肽分子和四肽分子的分子电负性,并计算了分子中所有位点有效电负性计算公式前两项的加和,然后分别计算了其算术平均值、几何平均值及调和平均值,与分子电负性进行了比较。通过比较发现,二肽分子与四肽分子均衡后的分子电负性与算术平均值最为接近,其相应的偏差均不超过±0.100 0eV。同时将此方法应用于PDB编码为1CRN的蛋白质,计算了其分子电负性,发现其同样与分子中所有位点的有效电负性计算公式前两项加和的算术平均值接近,偏差为-0.025 3eV。说明无论是多肽还是蛋白质分子,都可以根据分子中所有位点的有效电负性计算公式的前两项的算术平均值估算其分子电负性。

英文摘要:

ABEEMσπ method was used to calculate the electronegativity of several neutral dipeptides and tetrapeptides, then the arithmetic mean value, geometric mean value and harmonic mean value of the preceding two items added in the effective electronegativity calculation formula of all sites in molecule were calculated to compare with the molecule electronegtivity. The electronegativity of dipeptides and tetrapeptides after equilibrium was close to the arithmetic mean value mostly, its deviation was not more than ± 0. 100 0 eV. This method was applied to calculate the electronegativity of protein 1CRN downloaded in PDB, the molecule electronegativity was close to the arithmetic mean value either and the deviation was - 0. 025 3 eV. It meant that whether polypeptides or proteins, the molecule electronegativity could be estimated according to the arithmetic mean value of the preceding two items added in the effective electronegativity calculation formula of all sites in molecule.

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期刊信息
  • 《大连工业大学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:辽宁省教育厅
  • 主办单位:大连工业大学
  • 主编:赵琛
  • 地址:大连市甘井子区轻工苑1号
  • 邮编:116034
  • 邮箱:xuebao@dlpu.edu.cn
  • 电话:0411-86323650
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-1404
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1560/TS
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 2000年获《CAJ-CD规范》执行优秀奖,2001年获大连市优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘
  • 被引量:1820