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Proteomic analysis of silkworm midgut cellular proteins interacting with the 5' end of infectious flacherie virus genomic RNA
  • ISSN号:1672-9145
  • 期刊名称:《生物化学与生物物理学报:英文版》
  • 时间:0
  • 分类:Q522[生物学—生物化学] S512.101[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]Silkworm Pathology and Disease Control Laboratory, College of Animal Sciences, Zhejiang University,Hangzhou 310058, China
  • 相关基金:This work was supported by the grants from National Natural Science Foundation of China (No. 31172262) and the Postdoctoral Founda- tion of China (No. 2013M531471).
中文摘要:

在蚕的 flacherie 疾病被传染 flacherie 病毒(IFV ) 引起。IFV 依靠它 genomic RNA 的 5 区域到成员实现病毒的翻译和复制的主人相关的因素。为了识别,招待 IFV RNA 的 5 区域一定的蛋白质并且识别为它的函数重要的蛋白质,集体 spectrometry 被用来从用 RNA 被获得的蚕 midgut 摘录识别蛋白质标记 aptamer IFV RNA 的 5 区域。我们发现 325 蛋白质组(唯一的肽 2 )包括翻译相关的因素的 IFV RNA 的 5 区域一定( 16 个 ribosomal 子单元, 3 个真核细胞的开始因素子单元, 1 个延伸因素子单元和 6 潜力内部核糖体入口地点交易因素),细胞骨架相关的蛋白质,膜相关的蛋白质,新陈代谢酶,并且另外的蛋白质。这些结果能被用来学习翻译,复制联系了在蚕与主人蚕并且到控制 flacherie 疾病交往的 IFV 的因素。

英文摘要:

The flacherie disease in the silkworm is caused by the infectious flacherie virus (IFV). IFV relies on its 5' region of genomic RNA to recruit host-related factors to implement viral translation and replica- tion. To identify host proteins bound to the 5'-region of IFV RNA and identify proteins important for its function, mass spectrometry was used to identify proteins from silkworm midgut extracts that were obtained using RNA aptamer-labeled 5' region of IFV RNA. We found 325 protein groups (unique peptide ≥2) bound to the 5' region of IFV RNA including translation-related factors (16 ribo- somal subunits, 3 eukaryotic initiation factor subunits, 1 elongation factor subunit and 6 potential internal ribosome entry site trans-acting factors), cytoskeleton-related proteins, membrane-related proteins, etabolism enzymes, and other proteins. These results can be used to study the translation and replication related factors of IFV interacting with host silkworm and to control flacherie disease in silkworm.

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期刊信息
  • 《生物化学与生物物理学报:英文版》
  • 北大核心期刊(2004版)
  • 主管单位:
  • 主办单位:中国科学院上海生物化学研究所
  • 主编:
  • 地址:上海岳阳路319号
  • 邮编:200031
  • 邮箱:abbs@sibs.ac.cn
  • 电话:021-54920956 54920955
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-9145
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1940/Q
  • 邮发代号:4-210
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:5851