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西瓜和黄瓜乙烯受体ETR1基因片段的克隆与序列比较分析
  • ISSN号:1000-7091
  • 期刊名称:《华北农学报》
  • 时间:0
  • 分类:S651[农业科学—果树学;农业科学—园艺学] Q781[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]东北农业大学生命科学院,黑龙江哈尔滨150030, [2]北京市农林科学院蔬菜研究中心,北京100097
  • 相关基金:国家“863”计划(2006AA10Z1A8);“十一五”国家科技支撑计划(2006BAD01A7.6.02);国家自然科学基金(30570997;30571276);北京市自然科学基金(5062008);北京市科委项目(Z0708050150702)
中文摘要:

乙烯受体基因ETR1是乙烯信号转导过程中的关键调控基因。研究根据ETR1基因的保守序列设计引物,以西瓜(Citrullus lanatus(Thunb.)Matsum&Nadai var.lanatus)和黄瓜(Cucumis sativus L.)的基因组DNA为模板进行PCR扩增,获得序列长度分别为1 633 bp和1 491 bp的基因片段CLETR1和CSETR1。序列分析表明,CLETR1和CSETR1与Genebank中收录的多条ETR1基因的核苷酸序列同源性在80%~98%,氨基酸序列同源性在75%~98%。西瓜和黄瓜ETR1基因片段的编码序列存在明显的单核苷酸变异,共23个核苷酸位点存在SNPs(Single nucleotide polymor-phisms),其中5个SNPs导致4个编码氨基酸的改变。

英文摘要:

ETR1 was the controlling gene in ethylene signal transduction.A pair of oligo nucleotide primers were designed from conserved domain of ETR1 gene family.PCR amplifications were performed on genomic DNA template of Citrullus lanatus(Thunb.) Matsum & Nadai var.lanatus and Cucumis sativus L.,they produced two fragments of 1 633 bp and 1 491 bp,named CLETR1 and CSETR1 respectively.The results of Blastn on NCBI Genebank database indicated that many highly matched homologous nucleic acid sequences and amino acid sequences were all ethylene receptor gene,the ratio were 80% -95% and 75% -90% respectively. The single sequences between CLETR1 and CSETR1 , there were 23 SNPs(single and 5 of them resulted 4 amino acids difference. nucleotide variations were found in the conserved nucleotide polymorphisms) in the encoding region,

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期刊信息
  • 《华北农学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:河北省农林科学院
  • 主办单位:山西省农业科学院 山西省农学会 河南省农业科学院 河南省农学会 天津市农业科学院 天津市农学会等
  • 主编:王海波
  • 地址:石家庄市和平西路598号
  • 邮编:050051
  • 邮箱:hbnxb@163.com
  • 电话:0311-87652166
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-7091
  • 国内统一刊号:ISSN:13-1101/S
  • 邮发代号:18-10
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,全国综合性农业核心期刊,中国科学引文数据库核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:32962