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小孢子链格孢endoPG基因核苷酸序列分析及系统发育研究
  • ISSN号:1672-6472
  • 期刊名称:《菌物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q939.96[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]西北农林科技大学植物保护学院,杨凌712100
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(No.30670013);教育部长江学者和创新团队发展计划资助项目(No.200558)
中文摘要:

对供试小孢子链格孢菌株的内聚半乳糖醛酸酶(endoPG)基因进行扩增,大部分菌株都可获得PCR产物。核苷酸和氨基酸序列比较表明:不同种小孢子链格孢endoPG基因核苷酸序列存在明显差异,甚至表现在氨基酸水平,这些差异可以作为一些种如梨黑斑链格孢、长柄链格孢区分的分子性状。利用邻近结合法构建系统发育树,所有菌株被分为8个聚类组。在系统发育树上,链格孢的一些不同分离物被聚在不同组中,而细极链格孢、链格孢的部分菌株、苹果链格孢、柑橘链格孢、粗柠檬褐斑链格孢、橘树链格孢被聚为一组,显示根据形态学特征划分的这些种与分子性状的不一致性。endoPG基因核苷酸序列富于变化,为小孢子链格孢系统发育研究提供了一种有用的手段。

英文摘要:

EndoPG genes of small-spored Alternaria species were amplified with specific primer pairs, most of strains could produce a single same size band. Nucleotide acid and amino acid sequences were compared. It was found that there were some differences in nucleotide and amino acid sequences among the species, such as Alternaria longipes and A. gaisen. Phylogenetic tree were constructed using neighbor-joining method, all of the isolates were distributed in eight clades. Isolates of A. alternata were clustered into different groups, but A. tenuissima, A. mali, A. cirri, A. limoniasperae, A. citriarbusti were assembled to a same group, it showed the species segregation incongruence based on unstable morphological characters and molecular data. There are great variations among the small-spored Alternaria species of the endoPG gene sequences, which could provide useful information for phylogenetics of small-spored Alternaria species.

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期刊信息
  • 《菌物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院微生物研究所 中国菌物学会
  • 主编:戴玉成
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
  • 邮编:100101
  • 邮箱:jwxt@im.ac.cn
  • 电话:010-64807521
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-6472
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5180/Q
  • 邮发代号:2-499
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:5637