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湖北钉螺多态微卫星DNA位点筛选和特征初步分析
  • ISSN号:1005-6661
  • 期刊名称:中国血吸虫病防治杂志
  • 时间:0
  • 页码:122-125
  • 语言:中文
  • 分类:R383.24[医药卫生—医学寄生虫学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所,上海200025, [2]陕西师范大学生命科学学院, [3]第二军医大学病原生物学教研室
  • 相关基金:国家自然科学基金(30590373); 世界卫生组织TDR项目(970990); 科技部重大支撑专项(2003DIA6N009 2005DKA21104 2007BAC03A02); 国家传染病重大专项(2008ZX10004-011)
  • 相关项目:基于现代信息技术研究传染病时空传播与流行规律
中文摘要:

目的分离湖北钉螺的微卫星DNA序列,筛选多态的微卫星DNA位点并分析其特征。方法应用湖北钉螺基因组DNA的酶切片段与生物素标记的(AAT)17、(GA)25、(CCT)17、(CA)25等10个寡核苷酸探针杂交,富集、浓缩、克隆并测序,构建微卫星DNA库。挑选合适的微卫星DNA位点设计并合成引物,扩增钉螺样本经聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选多态性。结果获得湖北钉螺微卫星DNA序列205条,GenBank注册登记号GU204044~GU204248,其中完整重复序列74条,占36.10%;非完整重复序列102条,占49.76%;复合重复序列29条,占14.15%。设计合成的20对微卫星DNA位点引物中,经鉴定显示13个位点具有多态性。结论分离建立了湖北钉螺微卫星DNA序列库,为湖北钉螺群体遗传、种群溯源等相关研究提供了分子标志。

英文摘要:

Objective To isolate the microsatellite DNA sequences of Oncomelania hupensis and analyze the polymorphic microsatellite loci.Methods The digested genomic fragments were hybridized with biotinylated oligonucleotide probes.The target fragments moleculars were captured and enriched.Then these fragments were cloned and sequenced.The suitable microsatellite loci were chosen and the polymorphism was screened by PAGE gel electrophoresis.Results A total of 205 microsatellite DNA sequences were obtained (GenBank accession numbers:GU204044~GU204248).The percentage of perfect microsatellite DNA sequence was 36.10% (74/205),with imperfect sequence as 49.76% (102/205) and compound sequence as 14.15% (29/205).Twenty typical microsatellite sequences were selected to design amplifying primers,and 13 microsatellite loci were found to be polymorphism.Conclusion A total of 205 microsatellite DNA sequences of Oncomelania hupensis are isolated and first reported,which will be useful for population genetic and mapping studies of Oncomelania hupensis.

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期刊信息
  • 《中国血吸虫病防治杂志》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:江苏省血吸虫病防治研究所 中华预防医学会
  • 主编:周晓农
  • 地址:江苏省无锡市梅园
  • 邮编:214064
  • 邮箱:xfbjb@vip.163.com
  • 电话:0510-68781021 68781022
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-6661
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1374/R
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 第三届国家期刊奖提名奖,中华预防医学会系列杂志优秀期刊一等奖,卫生部首届医药卫生优秀期刊一等奖,第二届江苏期刊方阵优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国生物医学检索系统,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:8477