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应用新一代测序技术测定大室别藻苔虫线粒体基因组全序列
  • ISSN号:0253-4193
  • 期刊名称:海洋学报(中文版)
  • 时间:0
  • 页码:136-142
  • 分类:Q915.815[天文地球—古生物学与地层学;生物学—古生物学]
  • 作者机构:[1]淮海工学院海洋学院,江苏连云港222005, [2]中国科学院北京生命科学研究院,北京100101, [3]中国科学院海洋研究所,山东青岛266071
  • 相关基金:国家自然科学基金(40906067); 中国科学院基金(Y064021BJ1;0869011BJ5); 江苏省“青蓝工程”人才基金(苏教师[2010]27号)
  • 相关项目:基于线粒体基因组全序列的唇口目苔藓动物系统发育研究
中文摘要:

线粒体基因组的获得传统上通常是采取长PCR结合鸟枪法或步移法测序。近年来新一代测序技术蓬勃发展,以454,Solexa和SOLiD测序平台为代表。应用新一代高通量测序技术(Solexa)并结合巢式PCR扩增,完成了大室别藻苔虫(Membranipora grandicella)的线粒体基因组全序列。大室别藻苔虫线粒体基因组是目前国际上获得的第一条苔藓动物软壁亚目线粒体基因组全序列,基因组全长为15 861bp,比已完成的4种苔藓动物线粒体基因组略大。大室别藻苔虫线粒体基因组包含13个蛋白质编码基因、2个核糖体RNA基因和20个转运RNA基因。通过与已测得的苔藓动物进行比较,发现目前已完成的5个苔藓动物线粒体基因组的基因排列顺序显著不同。苔藓动物线粒体基因组基因排列的比较,今后可能会成为探讨该类群系统演化关系的重要信息来源。

英文摘要:

Traditionally,the mitochondrial genome sequences were usually obtained by shotgun or primers-walking combination with long PCR.The next-generation sequencing technologies are developing fastly in recent years,such as 454,Solexa and SOLiD sequencing platform.Membranipora grandicella complete mitochondrial genome sequence was determined based on next-generation high-throughput sequencing technology(Solexa) and nested PCR amplification.The complete mitochondrial genome of M.grandicella is 15,861 bp in length,which is the first representative from the suborder Malacostegina(Bryozoa),and is relatively larger when compared with mtDNAs of other study bryozoans.The mitochondrial genome contains 13 protein-coding genes,two ribosomal RNAs and 20 transfer RNAs.Compared with other study bryozoans,gene arrangements of five bryozoans mitochondrial genomes are significantly different.Comparison of bryozoans mitochondrial gene arrangements can be important information sources for exploring the phylogenetic relationships within the group.

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期刊信息
  • 《海洋学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国海洋学会
  • 主编:陈大可
  • 地址:北京市海淀区大慧寺路8号
  • 邮编:100081
  • 邮箱:hyxbl@263.net
  • 电话:010-62179976
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-4193
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2055/P
  • 邮发代号:82-284
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18197