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一种利用整合酶位点特异性重组构建随机突变库的方法
  • ISSN号:1674-568X
  • 期刊名称:《基因组学与应用生物学》
  • 时间:0
  • 分类:Q[生物学]
  • 作者机构:复旦大学、生命科学学院、微生物与微生物工程实验室,上海200438
  • 相关基金:本研究由中国国家基础研究发展973计划(2012CB721102)和自然科学基金(31300034)共同资助
作者: 汪先薇
中文摘要:

易错PCR利用的低保真聚合酶不具有3’到5’的校对功能,能够引入较高几率的随机突变,经常被用来构建突变库。位点特异性串联重组(SSRTA)方法拥有丰富的整合位点配对组合,可以为大片段基因簇重组提供多种模块组合。该串联重组方法特异性高、灵活性强、重组发生效率高。在通过易错PCR构建突变库时,引入用整合酶的体外多片段串联重组拼装系统,能够突破PCR长度的限制,灵活的组装各个突变模块,从而获得大片段的基因簇突变库。本研究以番茄红素基因簇的突变为例,阐释了这两种方法结合的应用。

英文摘要:

Error-prone PCR is usually utilized to build genetic mutation library in vitro, which based on the low-fidelity polymerase does not have 3' to 5' proofreading function, and make it possible to introduce a higher probability of random mutations. Site-Specific Recombination based Tandem Assembly (SSRTA) method with its high diversity of integration sites pairs, provides a variety of combinations in the recombination of large-scare multi-gene cluster, especial in microbial secondary metabolism cluster, which has been proven possessing highly specificity, flexibility, and efficiency in recombination. The introduction of integrase mediated SSRTA system while using error-prone PCR to construct mutant libraries in vitro, can break through the limitation of the length of the PCR, assembling each module more flexible, and achieving the construction of a large fragment of the mutant gene cluster library. In this research, we take lycopene gene cluster as an example to illustrate the application of these two methods combination.

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期刊信息
  • 《基因组学与应用生物学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广西大学
  • 主办单位:广西大学
  • 主编:朱玉贤
  • 地址:广西南宁市大学东路100号广西大学西校园《基因组学与应用生物学》编辑部111室
  • 邮编:530004
  • 邮箱:gab@hibio.org 571388455@qq.com
  • 电话:0771-3239102
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-568X
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1369/Q
  • 邮发代号:48-213
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高校学校自然科学学报,教育部优秀科技期刊,广西优秀科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4299