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稀有鮈鲫(Rare gudgeon)Sox基因的克隆及序列分析
  • ISSN号:1671-8836
  • 期刊名称:《武汉大学学报:理学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q953[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]武汉大学生命科学学院,湖北武汉430072, [2]湖北中医学院生物教研室,湖北武汉430061
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30370772)
中文摘要:

根据人的SRY基因中HMG-box保守区设计引物,采用PCR技术在稀有鮈鲫雌雄个体基因组DNA中分别扩增,发现3个大小分别为220、700和1500bp的片段,经过克隆和测序分析,从220bp的片段中获得两个基因片段,证明为稀有鮈鲫的Sox1和Sox21基因片段,无性别差异,其DNA序列与人及斑马鱼相应Sox基因相似性分别为Sox1:80.4%和97%;Sox21:77.3%和9l%,其编码的氨基酸序列与人及斑马鱼相应SOX蛋白相似性分别为Sox:96%和98%;Sox21:88%和100%,显示了其高度的保守性.此外,从GenBank、MEBL和DDBJ数据库获得了92个已克降的物种SRY和Sox基因全长核苷酸编码序列及HMG保守区序列数据.通过对这些数据进行序列比对及策类树的构建,分析了Sox基因家族成员的分类及分子进化模式,对稀有鮈鲫的性别决定进行了探讨,为Sox基因的进化研究提供分子基础.

英文摘要:

Using the primers, which specially amplify the conservative motif of the human SRY gene, we analyzed the Sox genes of Gobiocyprisrasus. Three amplification bands with the length 220,700,1500 bp respectively were observed. Two different fragments of Sox gene were selected and sequenced from fragments of the 220 bp band. There was no sex difference in the two fragments. The identity of amino acid sequence that encoded by GrSox1 to human and zebrafish is 96% and 98%. The amino acid sequence encoded by GrSox21 has about 88% and 100% identical to the human SOX21 and zebrafish SOX21. Phylogenetic analysis of 92 Sox genes including SRY genes and the encoded amino acid sequences, which were obtained from the GenBank, MEBI. and DDBJ database reveals that the Sox genes were highly conserved.

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期刊信息
  • 《武汉大学学报:理学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国2教育部
  • 主办单位:武汉大学
  • 主编:刘经南
  • 地址:湖北武昌珞珈山
  • 邮编:430072
  • 邮箱:whdz@whu.edu.cn
  • 电话:027-68756952
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-8836
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1674/N
  • 邮发代号:38-8
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),德国数学文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:6988