位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
真菌类过氧化物酶体增殖因子PEX11基因家族生物信息学研究
  • ISSN号:0253-9772
  • 期刊名称:遗传
  • 时间:0
  • 页码:635-646
  • 分类:Q959.4[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]杭州师范大学生命与环境科学学院,杭州310036, [2]浙江省植物有害生物防控重点实验室一省部共建国家重点实验室培育基地,浙江省农业科学院植物保护与微生物研究所,杭州310021
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(编号:30900933;30970082;31170136)资助
  • 相关项目:稻瘟病菌侵染相关的过氧化物酶体发生、增殖与降解过程及相关基因分析
中文摘要:

PEX11基因家族成员是参与过氧化物酶体增殖调控的关键因子,文章利用生物信息学方法对26种代表性真菌的PEX11基因家族成员进行了检索和进化分析。研究发现:(1)26种真菌中共有66个可能的PEX11p。酵母类真菌有1个或2个PEX11p,而大多数丝状真菌中包含2到3个,其中子囊菌中PEX11p的个数偏多,个别种类达到5个;(2)真菌PEX11p可分为3类,大多数真菌含有类型Ⅰ和类型Ⅲ的PEX11p,类型Ⅱ是盘菌亚门真菌所特有的,可能与类型Ⅰ和类型Ⅱ在功能上有冗余;(3)通过MEME分析,发现PEX11p含有多个保守区域,其中C末端的Motif8具有很高的保守性,推测可能对PEX11p发挥功能具有重要作用。文章对进一步研究真菌PEX11p的进化与功能以及过氧化物酶体的增殖具有重要意义。

英文摘要:

The family members of PEXll are key factors involved in regulation of peroxisome proliferation.Sixty-six PEX11p candidates ofPEXll gene family from26 representative fungal species were obtainedand analyzed by bioinfor-matic strategies.In most filamentous fungi,2 or 3 potential PEXllps were found,in contrast with 1 or 2 in yeast species.Compared with other fungal species,the Ascomycetes tend to have more PEX()ps,and even 5 in several individuals.The data ofphylogenetic analysis and protein structure indicated that all of the PEX11ps were divided into 3groups:Ⅰ,Ⅱ,and Ⅲ.The members of group Ⅰ and grouplIIexisted in most species,while those in group II were found only in Pezizomycotina.By MEME analysis,5-6 conserved motifs were found in each PEXllps.Among them,motif 8 in C-terminal had the most conservation,indicating that this motif probably plays a key role in maintaining the proper functionof PEX1 lp.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《遗传》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国遗传学会
  • 主编:张永清
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院中国科学院遗传发育所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:yczz@genetics.ac.cn
  • 电话:010-64807669
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-9772
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1913/R
  • 邮发代号:2-810
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,《CAJ-CD》执行优秀奖,2008年12月获“中国精品科技期刊”证书和北京市印...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:23270