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内蒙古绒山羊皮肤KRTAPs表达谱与日照时长的相关性
  • ISSN号:1671-9387
  • 期刊名称:《西北农林科技大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:S827.2[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]内蒙古农业大学动物科学学院,内蒙古呼和浩特010018, [2]内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室,内蒙古呼和浩特010018
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31360537,31272421);国家“863”计划项目(2013AA102506)
中文摘要:

【目的】研究绒山羊皮肤部分角蛋白关联蛋白(keratin-associated protein,KRTAPs)基因的表达谱及其与全年日照变化规律间的相关性。【方法】以3只周岁阿尔巴斯型内蒙古绒山羊体侧皮肤为样本,进行高通量转录组测序(RNA-Seq),对获得的部分KRTAPs基因一年内不同月份间的转录本进行表达丰度分析,并结合当地全年日照变化规律与RT-PCR试验方法,验证KRTAP24-1、KRTAP3-1、KRTAP8-1在关键节点月份的表达谱,确定全年皮肤KRTAPs表达丰度变化与日照变化规律间的相关性。【结果】Illumina solexa高通量转录组测序表明,内蒙古绒山羊全年皮肤部分KRTAPs基因的表达具有规律性差异。RT-PCR试验验证表明,部分基因表达谱与测序表达丰度具有一致性,并且基因差异变化规律与全年日照时长的变化具有相关性。【结论】全年日照时长由长变短(夏-冬)时皮肤KRTAPs表达丰度上调,日照时长由短变长(冬-夏)时皮肤KRTAPs表达丰度下调。

英文摘要:

[Objective] The expression patterns of skin keratin-associated proteins (KRTAPs) in Arbas cashmere goat were investigated and the relationship with sunshine duration was analyzed. [Method] The skin of three one year old Arbas cashmere goat was used for high-throughput sequencing and the obtained information was used for abundance analysis. Then the yearly solar radiation change and RT-PCR technique were used to verify the expressions of KRTAP24-1,KRTAP3-1,and KRTAP8-1. The relationship be- tween expression abundance and solar radiation duration was also analyzed. [Result] The KRTAPs ex- pression pattern had certain regularity based on illumine solexa sequencing. RT-PCR showed that some ex- pression profiles were identical to expression abundance and the variations of gene expression were related with solar radiation duration. [Conclusion] When the sunshine duration lengthens (summer to winter) ,the KRTAPs expression increases while it decreases when sunshine duration shorten. (winter to .summer)

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期刊信息
  • 《西北农林科技大学学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学
  • 主编:山仑
  • 地址:陕西杨陵西北农林科技大学西农校区40信箱
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xb2511@yahoo.com.cn
  • 电话:029-87092511
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-9387
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1390/S
  • 邮发代号:52-82
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:32360