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35个粳稻品种SSR指纹图谱的构建及遗传相似性分析
  • ISSN号:1000-2030
  • 期刊名称:《南京农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S551.23[农业科学—作物学] S339.31[农业科学—作物遗传育种;农业科学—农艺学]
  • 作者机构:[1]南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京210095, [2]黄山学院资源与环境系,安徽黄山245041
  • 相关基金:长江学者和创新团队发展计划(IRT0432)
中文摘要:

用68对SSR引物扩增了35个粳稻品种(系)的基因组DNA,结果有46对引物在35个品种间具有稳定多态性。有6个品种可用单一特异的SSR标记加以识别,其余29个品种则需要不同的SSR指纹组合才能识别。用12对核心引物构建的SSR指纹图谱能将35个粳稻品种逐一区别开来。35个粳稻品种间遗传相似系数的变异范围为0.27~0.98。采用类平均法进行聚类分析,在相似系数0.82处,可将35个粳稻品种分为4类。聚类分析结果基本上反映了依据系谱分析的品种问亲缘关系。

英文摘要:

The genomic DNA of 35 japonica rice varieties were amplified by 68 pairs of SSR primers, Forty-six primers could amplify stable polymorphism among the 35 varieties. 6 varieties could be identified by single SSR marker, while the other 29 varieties could be identified by combination of different SSR fingerprint. All the 35 varieties could be distinguished each other by the fingerprint map constituted by 12 pairs of core SSR primers. The genetic similarity coefficients of the 35 varieties ranged from 0. 27 to 0. 98. Furthermore, all the varieties were classified into 4 groups, at the level of genetic similarity coefficient 0. 82 according to cluster analysis by an un-weighted pair-group average method with arithmetic mean. As expected, the result of cluster reflected basically the genetic relatives based on the pedigree analysis.

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期刊信息
  • 《南京农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:南京农业大学
  • 主编:郑小波
  • 地址:江苏省南京市卫岗1号
  • 邮编:210095
  • 邮箱:nauxb@njau.edu.cn
  • 电话:025-84395214
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2030
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1148/S
  • 邮发代号:28-53
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,全国优秀科技期刊,第二届江苏省十佳科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:22558