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草鱼诱导型一氧化氮合酶cDNA和启动子的克隆及分析
  • ISSN号:1000-7083
  • 期刊名称:四川动物
  • 时间:0
  • 页码:510-516
  • 分类:Q959.4[生物学—动物学] Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]电子科技大学生命科学与技术学院,成都610054
  • 相关基金:电子科技大学青年科学基金项目资助(L08010901JX0856); 国家自然科学基金(30972280)
  • 相关项目:TGF-β1双向调节硬骨鱼外周血淋巴细胞活性机理的研究
中文摘要:

应用PCR和RACE技术,以细菌脂多糖(LPS)刺激的草鱼头肾白细胞cDNA为模板,获得草鱼iNOS(In-ducible nitric oxide synthase)全长cDNA序列。该序列共4286 bp,编码含1080个氨基酸残基的蛋白。氨基酸序列比对分析发现草鱼iNOS与金鱼iNOS a和b、斑马鱼iNOS 2b以及鲤鱼iNOS高度保守,序列一致性均大于80%;它们的血红素、四氢生物蝶呤、钙调蛋白、FMN、FAD和NADH等辅因子结合区域也十分保守。用NJ法对新获得的序列和其它脊椎动物NOS的编码序列进行进化分析证实它属于诱导型NOS。在此基础上,运用基因步移技术分离草鱼iNOS基因的启动子序列,共有1978 bp。生物信息学分析发现该序列含有包括GR、AP1、C/EBP、ER、YY1、IRF1和IL-6 REBP在内的多个转录因子的潜在结合位点。

英文摘要:

The full length cDNA of grass carp iNOS was isolated from LPS-stimulated grass carp head kidney leucocytes by using PCR amplification coupling to 5'-and 3'-RACE.This cDNA was 4286 bp in length which encodes a protein with 1080 amino acid residues.Amino acid alignment showed that the identities between grass carp iNOS and goldfish iNOS,zebrafish iNOS2b and common carp iNOS were all more than 80%.The cofactor-binding sites for heme,tetrahydrobiopterin,calmodulin,FMN,FAD pyrophosphate,FAD isoalloxazine,NADPH ribose,NADPH adenine and NADPH are also highly conserved in these sequences.Phylogenetic analysis confirmed that this newly cloned iNOS is a member of inducible NOS.The promoter sequence of grass carp iNOS with 1978 bp was also obtained by using the Genome Walker Universal kit.Multiple transcription factors including GR,AP1,C/EBP,ER,YY1,IRF1 and IL-6 REBP binding sites were revealed by using transcription element search system in this study.

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期刊信息
  • 《四川动物》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:四川省科学技术协会
  • 主办单位:四川省动物学会 四川省野生动物保护协会
  • 主编:岳碧松
  • 地址:成都市望江路29号四川大学生命科学学院内
  • 邮编:610064
  • 邮箱:scdwzz001@163.com
  • 电话:028-85410485
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-7083
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1193/Q
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 四川省首届优秀期刊评比获二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:8319