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簇毛麦新型低分子量谷蛋白亚基的分子克隆与序列分析
  • ISSN号:1009-1041
  • 期刊名称:麦类作物学报
  • 时间:2011
  • 页码:217-223
  • 分类:S512.9[农业科学—作物学] S330[农业科学—作物遗传育种;农业科学—农艺学]
  • 作者机构:[1]西北农林科技大学农学院,陕西杨凌712100, [2]陕西省小麦工程技术研究中心/陕西省小麦新品种培育工程研究中心,陕西杨凌712100
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30900896); 陕西省“13115”科技创新工程重大项目(2007ZDKG-01); 农业部现代农业产业技术体系建设专项(NYCYTX-001); 中央高校基本科研业务费专项资金项目(QN2009007)
  • 相关项目:中国春-簇毛麦易位系的加工品质效应及相关外源基因的挖掘与利用
中文摘要:

为发掘低分子量谷蛋白亚基(LMW-GS)新的变异类型,通过设计引物和特异PCR扩增,从簇毛麦TA2127基因组DNA中得到14个LMW-GS基因,GenBank登录号分别为HQ615147~HQ615160。序列分析表明,所有基因具有完整编码区,长度为831bp和846bp,可编码277和282个氨基酸残基,推导的氨基酸序列分析显示,14个基因编码的蛋白序列都缺少一段N-端保守区,且N-端序列是一种新的类型;在14个LMW-GS基因中检测到19个SNPs和1个16bp的缺失。系统进化分析表明,簇毛麦LMW-GS与ω-醇溶蛋白和HMW-GS亲缘关系相对较远,与普通小麦Glu3-的低分子谷蛋白基因进化关系相对较近。

英文摘要:

In order to discover new LMW-GS genes and provide more important information for the further genetic improvement,fourteen novel LMW-GS genes(GenBank accession number: HQ615147~HQ615160) from Dasypyrum villosa(TA2127) were amplified and cloned using PCR-based strategy.The lengths of the open reading frames(ORF) of those LMW-GS genes were 831 and 846 bp,encoding a mature protein of 277 and 282 amino acid residues.Comparative analysis showed that all genes lacked the conserved sequence of N-terminal,and the N-terminal was new types.A total of nineteen single nucleotide polymorphisms(SNPs) and a 16 bp deletion among the fourteen LMW-GS genes were identified.Phylogenetic and evolutionary analysis revealed that the LMW-GS genes from Dasypyrum villosa were closely related to LMW-GS genes of Glu-3 and less homology was found between LMW-DV genes with HMW-GS and ω-gliadin genes.

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期刊信息
  • 《麦类作物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 中国作物学会 国家小麦工程技术研究中心
  • 主编:孙其信
  • 地址:陕西省杨凌邰城路3号《麦类作物学报》编辑部
  • 邮编:712100
  • 邮箱:mlzwxb@163.com
  • 电话:029-87082032
  • 国际标准刊号:ISSN:1009-1041
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1359/S
  • 邮发代号:52-66
  • 获奖情况:
  • 从2003年起被收录为国家科技部“中国科技核心期刊”,2002年获第三届全国优秀农业期刊一等奖,1999年获陕西省科技期刊一等奖,1995年获陕西省优秀期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:13981