位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
肝癌细胞系Hep3B的泛素化蛋白质组学
  • ISSN号:1000-3061
  • 期刊名称:《生物工程学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q51[生物学—生物化学]
  • 作者机构:军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心北京北京蛋白质组研究中心蛋白质药物国家工程研究中心,北京102206
  • 相关基金:国家重点基础研究发展计划(973计划)(Nos.2011CB910600,2013CB911200); 国家高技术研究发展计划(863计划)(Nos.SS2012AA020502,2011AA02A114); 国家自然科学基金(Nos.31070673,31170780); 国家科技支撑计划(No.2012BAF14B00)资助
中文摘要:

泛素化修饰是细胞内最重要的翻译后修饰形式之一,对细胞内蛋白质的稳定、降解、定位以及生物活性的调节起到重要作用。但因其在细胞内丰度低、降解周期短等特点而很难被检测。本研究中,制备的泛素结合结构域蛋白(Ubiquitin-binding domains,UBDs)用于富集肝癌细胞系Hep3B中的泛素化蛋白,并通过液相色谱-串联质谱联用的方法对富集的泛素化蛋白进行鉴定。实验共鉴定到1 900个潜在的泛素化蛋白和158个泛素化位点,这些被鉴定到的泛素化位点分属于102个蛋白。生物信息学分析发现泛素化蛋白显著富集的相关通路与肿瘤的发生发展密切相关,此结果暗示肿瘤细胞内泛素化-蛋白酶体的失调与肿瘤细胞的信号传导及细胞外基质的变化等具有较高的关联性。

英文摘要:

Ubiquitination is one of the most major post-translational modifications playing important role in regulation of intra-cellular proteins' stability,degradation,localization and biological activity.However,these proteins are difficult to be detected due to their low abundance,short half-life.In this study,ubiquitin-binding domains(UBDs) were constructed to purify the ubiquitinated proteins from Hep3 B cells.Ubiquitinated proteins and sites were detected by LC-MS/MS.A total of 1 900 potential ubiquitinated proteins were identified.Among them,158 ubiquitinated sites were identified,belonging to 102 proteins.Bioinformatics analysis revealed that the enriched pathways of ubiquitinated proteins were closely related to tumor occurrence and development.The dysfunction of ubiquitin-proteasome has a high correlation with cell signaling and extracellular matrix changing in tumor cells.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《生物工程学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院微生物研究所 中国微生物学会
  • 主编:杨胜利
  • 地址:北京市朝阳区大屯路中国科学院微生物研究所内B401室
  • 邮编:100101
  • 邮箱:cjb@im.ac.cn
  • 电话:010-64807509
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-3061
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1998/Q
  • 邮发代号:82-13
  • 获奖情况:
  • 北京市优秀科技期刊期刊奖,中国科协首届优秀学术期刊奖,2000年中科院优秀科技期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18441