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类球红细菌LHⅡβ-亚基/α-亚基融合蛋白吸收光谱分析
  • ISSN号:1006-687X
  • 期刊名称:《应用与环境生物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学] S641.2[农业科学—蔬菜学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]重庆大学生物工程学院,重庆400044, [2]湖北省黄石市蔬菜科学研究所,湖北435002
  • 相关基金:国家自然科学基金(31100089); 中央高校基本科研业务项目(CDJX10232209)
中文摘要:

YABBY家族是植物中特有的一个小基因家族,具有典型N端C2C2型锌指结构域和C端螺旋环螺旋YABBY结构域。经同源序列比对分析,从番茄(Solanum Lycopersicon)中克隆了YABBY家族的一个转录因子,将其命名为SlYABBY5(Gen Bank登录号为AK246138)。生物信息学分析表明,SlYABBY5基因ORF长为549 bp,编码182个氨基酸残基,相对分子量为20.58 k D,等电点为8.78。实时荧光定量PCR表达模式分析表明,SlYABBY5基因可能参与果实和叶片的发育;SlYABBY5在IAA、ABA、GA3、ASA和低温胁迫下表达量下调,在高盐和叶伤胁迫下表达量上调。研究结果初步证实SlYABBY5参与番茄的生长发育以及响应非生物逆境胁迫,为SlYABBY5基因参与逆境信号途径及番茄生长发育的研究提供了理论依据。

英文摘要:

YABBY family is a small plant-specific gene family,with a typically N-terminal C2C2-type zinc finger domain and the C-terminal helix-loop-helix YABBY domain. By homologous sequence analysis, a YABBY transcription factor was cloned from tomato( Solanum lycopersicon),and named SlYABBY5( Gen Bank accession number: AK246138). By bioinformatics analysis,the length of SlYABBY5 ORF is 549 bp,encoding182 amino acid residues with relative molecular weight of 20. 58 k D and an isoelectric point of 8. 78. By realtime PCR analysis, SlYABBY5 gene might be involved in the development of tomato fruits and leaves.Expression of SlYABBY5 down-regulated under the treatments of IAA,ABA,GA3,ASA and low temperature stress,while up-regulated under salt stress and leaves wounding. Our results suggest that SlYABBY5 might participate in the growth and development of tomato and abiotic stress responses,and provide the basis for unrevealing the function of SlYABBY5 gene in tomato growth and development as well as stress signaling pathway.

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期刊信息
  • 《应用与环境生物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院成都生物研究所
  • 主编:吴宁
  • 地址:成都市人民南路4段9号
  • 邮编:610041
  • 邮箱:biojaeb@cib.ac.cn
  • 电话:028-82890917
  • 国际标准刊号:ISSN:1006-687X
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1482/Q
  • 邮发代号:62-15
  • 获奖情况:
  • 中国农业期刊金犁奖学术类一等奖(2006),* 中国期刊方阵双效期刊(2002年),* 四川省第二届优秀期刊(2000年),* 四川省一级学术期刊(1998年)
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:23016