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应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术筛选牙龈卟啉单胞菌共同外膜蛋白
  • ISSN号:1002-0098
  • 期刊名称:《中华口腔医学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R734.2[医药卫生—肿瘤;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]西安交通大学医学院附属口腔医院口腔医学研究中心,710004
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金(30500560);陕西省自然科学基础研究计划(2006C242)
中文摘要:

目的 应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术筛选多种牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,Pg)共同外膜蛋白(outer membrane protein,OMP),为针对多种Pg设计具有交叉保护作用的疫苗提供候选靶抗原.方法 应用超速离心法提取PgATCC33277、Pgw83、Pg301和Pg381菌株外膜蛋白,SELDI疏水性蛋白芯片H50检测OMP,Biomarker Wizard软件分析4种菌株OMP质谱图.结果 OMP质谱图显示,PgATCC33277、PgW83、Pg301和Pg381分别有71、74、76和72个蛋白质峰,并存在13种共同OMP 在美国国立生物信息中心蛋白库中鉴定到一种已知蛋白gil116636495,其功能尚不清楚.结论 发现13种共同OMP可作为牙周病疫苗候选抗原,证实基于SELDI-TOF-MS技术适合检测小相对分子质量(<20000)、低丰度、疏水性蛋白,且操作简单、重复性好,可用于大规模寻找Pg的共同OMP.

英文摘要:

Objective To analyze the common outer membrane proteins (OMP)from Porphyromonas gingivalis (Pg)by surface enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (SELDI-TOF-MS) and to provide antigens for the subsequent experiments in screening vaccine for periodontitis therapy. Methods Four strains of Pg were cultured under anaerobic conditions. The common OMP was extracted through ultracentrifugation and SELDI-TOF-MS was employed to detect the expressions of proteomes by chip H50. The data was analyzed by Biomarker Wizard. ResultsFour kinds of strains of OMP fingerprint spectrum were obtained. Seventy-one proteins of PgATCC33277, 74 proteins of PgW83, 76 proteins of PgW301 and 72 proteins of Pg381 were captured by chip H50. Thirteen common proteins were identified according to fingerprint spectrum. There was only 1 of the 13 common proteins identified in NCBI protein bank. ConclusionsSELDI-TOF-MS has good reproducibility and high sensibility and can be used to identify the common OMP of Pg. The 13 proteins have a potential value in the screening vaccine candidate antigen sites for periodontitis.

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期刊信息
  • 《中华口腔医学杂志》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中华医学会
  • 主编:
  • 地址:北京市东四西大街42号
  • 邮编:100710
  • 邮箱:cjst1953@cma.org.cn
  • 电话:010-85158254/5/6/7
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-0098
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2144/R
  • 邮发代号:2-64
  • 获奖情况:
  • 中国科协优秀科技期刊评比二等奖(1996),第二届全国优秀科技期刊评比三等奖(1996),入选“中国期刊方阵(双效期刊)”(2001)
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:24337