自主创新能力事关一国的核心竞争能力,我国在改革开放过程中非常重视自主创新能力的培育,并为此制定了专门针对高科技产业的税收优惠政策。然而,实证分析的初步结论表明,在影响企业自主创新能力的诸多外部影响因素中,税收具有显著作用,而在税收之中,企业自主创新活动对所得税的反应较为敏感。导致这种局面的原因部分可以从具体的优惠政策、优惠政策的税种分布以及其赖以生存的环境三方面得到解释,这些政策不利于创新主体的培育、不利于R&D资本的形成、也不利于激励创新人才及分散企业的创新风险。因此,在未来自主创新的税收优惠政策整合过程中,优惠目标、优惠方式与优惠重点三方面是实施整合的重点。