位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
葡萄白藜芦醇合酶基因的克隆及序列分析
  • ISSN号:1004-311X
  • 期刊名称:《生物技术》
  • 时间:0
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]华南农业大学食品学院, [2]华南农业大学生物质能研究所,广东广州510640
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31071837); 华南农业大学“211工程”项目(2009C010500001)资助
中文摘要:

目的:从葡萄中克隆白藜芦醇合酶基因vrs1并对其序列进行生物信息学分析。方法:利用葡萄总RNA为模板,采用RT-PCR技术克隆白藜芦醇合酶基因vrs1并亚克隆进T-Vector。利用生物信息学工具对其核酸和蛋白序列进行分析。结果:测序结果显示其cDNA序列全长为1 257bp,含有一个1 179bp的开放阅读框。生物信息学分析表明葡萄白藜芦醇合酶基因编码392个氨基酸,分子量为42.9kDa,理论等电点为5.97,具有芪合酶家族固有的氨基酸保守结构域,二级结构主要由α-螺旋、无规则卷曲、延伸链和β-转角组成。结论:该基因的克隆、生物信息学分析为进一步研究其功能奠定了基础。

英文摘要:

Objective: Resveratrol synthase gene vrs1 from Vitis vinifera was cloned and its sequence had been analyzed by bioinformatics.Method:Total RNA from Vitis vinifera was used as the template to clone the cDNA sequence of vrs1 by RT-PCR and the vrs1 fragment was subcloned into T-Vector.Bioinformatics softwares were used to analysis the cDNA and protein sequence.Result: The result of sequencing showed that the full length of cDNA is 1 257bp.The gene vrs1 contains an opening reading frame of 1 179bp,which coded for 392 amino acid residues,with molecular weight of 42.9kDa,theoretical PI of 5.97.Detailed analysis of the amino acid sequence reveal a conserved domain which found in all stilbene synthase sequences.The secondary structure of resveratrol synthase contain α-helix,β-corner,extending and random curling.Conclusion: The cloning and bioinformatic analysis of vrs1 from Vitis vinifera cv.Kyoho could provide the molecular base for further study of its biological functions.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《生物技术》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:黑龙江省科学院
  • 主办单位:黑龙江省科学院微生物研究所 黑龙江省微生物学会 黑龙江省生物工程学会
  • 主编:张介驰
  • 地址:哈尔滨市道里区兆麟街68号
  • 邮编:150010
  • 邮箱:swjszz@163.com
  • 电话:0451-84615121
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-311X
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1319/Q
  • 邮发代号:14-225
  • 获奖情况:
  • 中国生物学核心期刊,中国核心期刊(遴选)数据库...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:13503