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南极冰藻Chlam ydomonas sp.ICE-L RNA解旋酶CiDDX5的基因特征及其表达分析
  • ISSN号:1671-6647
  • 期刊名称:《海洋科学进展》
  • 时间:0
  • 分类:X834[环境科学与工程—环境工程]
  • 作者机构:[1]山东轻工业学院食品与生物工程学院,山东济南250353, [2]国家海洋局第一海洋研究所,山东青岛266061
  • 相关基金:国家自然科学基金项目--RNA解旋酶在南极海冰衣藻冰冻环境适应中的作用机制(41276203)
中文摘要:

DEAD-boxRNA解旋酶能介导NTP依赖的双链RNA解旋,大量的研究表明其在植物的各种非生物胁迫的适应过程中发挥着重要作用。本研究从严格嗜冷的南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L的EST序列中筛选并克隆得到了DEAD-boxRNA解旋酶CiDDX5的全长基因,利用生物信息学软件对该基因编码的蛋白序列进行了研究,并通过实时定量PCR研究了在低温、高盐胁迫下CiDDX5基因表达量的变化。研究结果显示,DEADboxRNA解旋酶CiDDX5基因的编码区长2077bp,编码513个氨基酸。在以氨基酸序列构建的系统进化树中,Ci-DDX5序列和其他绿藻类的聚在一起,与莱茵衣藻,团藻和胶球藻的蛋白序列同源性依次分别为65%,64%和63%。实时定量PCR研究结果表明,在低温和高盐胁迫下,CiDDX5基因的表达量都有一定程度的提高,提示该基因的功能与南极衣藻适应低温、高盐的海冰环境的特性相关。

英文摘要:

DEAD-box helicase not only mediated NTP-dependent double-stranded RNA helix, but also plays an important role in the process of plant adaptation to various abiotic stresses. A DEAD-box RNA helicase CiDDX5 gene was identified from the EST library of the Antarctic ice alga, Chlarnydornonas sp. ICE-L. The complete sequence of the CiDDX5 gene contained an open reading frame of 2,077 bps encoding a RNA helicase of 513 amino acids. Phylogenetic analysis showed that the gene was homologous to the known green algae RNA helicase genes with identities of 65%, 64% and 63% to C. reinhardtii, Volvox carteri and Chlorella vulgaris respectively. The expressions of CiDDX5 gene were up-regulated under both the low temperature and high salinity stress conditions, which indicated the role of CiDDX5 gene in the regulation of abiotic stress adaptation of Antarctic ice alga Chlamydornonas sp. ICE-L.

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期刊信息
  • 《海洋科学进展》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:国家海洋局科技司
  • 主办单位:中国海洋学会 国家海洋局第一海洋研究所
  • 主编:袁业立
  • 地址:青岛市高新技术区仙霞岭路6号
  • 邮编:266061
  • 邮箱:hbhh@chinajournal.net.cn
  • 电话:0532-88967804
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-6647
  • 国内统一刊号:ISSN:37-1387/P
  • 邮发代号:24-58
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,中文核心期刊,中国科技核心期刊,IAPSO中国委员会特约期刊,第三届华东地区优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4854