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10种观赏植物查尔酮合成酶基因生物信息学分析
  • ISSN号:1672-8246
  • 期刊名称:《西部林业科学》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]西南林业大学西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室,云南昆明650224
  • 相关基金:基金项目:云南省省院省校教育合作咨询共建重点学科(211015),国家林业局948项目(2012-4-62),国家自然科学基金委员会一云南省人民政府联合基金项目(U0933601).
中文摘要:

运用分子生物学软件对金花茶、菊花、杜鹃、荷花、金银花、贯叶金丝桃、牡丹、龙胆、桃树、兜兰10种观赏植物的查尔酮合成酶基因(CHS)进行核酸序列预测和分析,采用邻接距离矩阵法构建了系统发育树,并进行系统发育分析,结果表明,(1)观赏植物查尔酮合成酶基因所编码蛋白质为稳定的疏水性单链蛋白质,以仪一螺旋和无规则卷曲为主;(2)可能在游离核糖体上合成后不经蛋白转运,直接在细胞质基质的特定部位中行使催化功能;(3)查尔酮合成酶的作用机制可能与组织特异性和发育阶段以及对外界不同刺激敏感程度相关;(4)查尔酮合成酶基因具有超基因家族,CHS基因在进化中存在基因重复与分歧,其保守性好,除桃树有2个外显子,其余植物只有1个外显子,且几种植物的CHS外显子剪切位点不同;(5)龙胆与其他植物的关系较远,杜鹃与金花茶、牡丹与菊花的关系都较近。

英文摘要:

The chalcone synzyme genes (CHS) of 10 ornamental plants including Chrysanthemum morifolium, Camellia nitidissima, Hypericum perforatum, Prunu spersica, Nelumbo nucifera, Paphiopedilum concolor, Lonice- ra japonica, Rhododendron simsii, Paeonia suffruticosa and Gentiana triflora, were studied. Amino acids se- quences analysis and protein prediction were conducted. The results of this study indicated that chalcone synzyme genes encoded stable single hydrophobic proteins, composed of random coil and ~-helix. They may play a special role in catalyzing in cytoplasmic matrix without transporting by protein, after they were synthesized on free ribo- somes. Mechanism of CHS may be related to tissue specificity and different developmental stage and the outside stimulation sensitivity. There were superfamilies, gene duplication and divergence in the evolution among CHS. The results also showed that Gentiana triflora had distant relationship from other plants, the genetic relationships between Rhododendron simsii and Lonicera japonica, Paeonia suffruticosa and Chrysanthemum morifolium were close.

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期刊信息
  • 《西部林业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:云南省林业厅
  • 主办单位:云南省林业科学院 云南省林学会
  • 主编:王卫斌
  • 地址:昆明市黑龙潭云南省林业科学院内
  • 邮编:650201
  • 邮箱:jwcfs@vip.163.com
  • 电话:0871-65151502
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-8246
  • 国内统一刊号:ISSN:53-1194/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊奖,云南省优秀期刊奖,改革创新奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:4931