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拟南芥花粉表面蛋白质数据的整合
  • ISSN号:1000-5137
  • 期刊名称:《上海师范大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q344.4[生物学—遗传学]
  • 作者机构:[1]上海师范大学生命与环境科学学院,上海200234
  • 相关基金:科技部重大科学研究计划(2007CB947600).
中文摘要:

花粉表面蛋白质参与花粉与柱头的识别,在植物繁殖生长过程中起着重要的作用.以拟南芥为研究对象,通过文献和网络资源的查阅收集其他植物的花粉表面蛋白质的信息,并利用同源性分析,将其转化为拟南芥的花粉表面蛋白相关信息;并将这些数据和拟南芥中已知及可能的花粉表面蛋白质数据整合在一起.然后,对整合的所有蛋白质进行了功能分类和表达分析,并建立了拟南芥花粉表面蛋白质数据库.这对深入研究花粉与柱头识别的分子机理将有重要的促进作用.

英文摘要:

Pollen surface proteins are involved in the recognition between pollens and stigma, and play crucial roles in plant growth and reproduction. In this paper, a database of Arabidopsis pollen surface proteins has been constructed. Pollen surface proteins in other plant species have been collected by paper - reading and web - searching. Homology analysis of these proteins have been carried oat to obtain the candidate pollen surface proteins in Arabidopsis. These data were then integrated with known and putative Arabidopsis pollen surface - located protein data. Besides, functional classification and expression analysis of all intergrated proteins have also been processed and a database of arabidopsis pollen surface proteins has been constructed. The intergration of pollen surface proteins will facilitate the further research on molecular mechanism of pollen - stigma recognition.

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期刊信息
  • 《上海师范大学学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:上海市教育委员会
  • 主办单位:上海师范大学
  • 主编:丛玉豪
  • 地址:上海市桂林路100号
  • 邮编:200234
  • 邮箱:xuebao@shnu.edu.cn
  • 电话:021-64322304
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-5137
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1416/C
  • 邮发代号:4-655
  • 获奖情况:
  • 2010年获教育部“中国科技论文在线优秀期刊”二等奖,2011年获中国高校科技期刊研究会第二届全国高师学...,2013年获中国高校科技期刊研究会高师学报系统的“...
  • 国内外数据库收录:
  • 德国数学文摘,中国中国科技核心期刊
  • 被引量:3487