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基于Cytoscape等生物信息学分析软件预测荜茇明碱抗肿瘤靶基因
  • ISSN号:1007-3213
  • 期刊名称:《广州中医药大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:R285.5[医药卫生—中药学;医药卫生—中医学]
  • 作者机构:上海中医药大学附属上海市中医医院,上海200071
  • 相关基金:国家自然基金面上项目(编号:81473627); 上海市自然科学基金面上项目(编号:14ZR1439000); 上海市卫生局重点项目(编号:20134016); 上海申康医院发展中心、上海市市级医院新兴前沿技术联合攻关项目(编号:SHDC12014127)
中文摘要:

荜茇明碱是从胡椒科植物中分离出的天然生物碱(酰胺类),具有多种药理作用。通过收集总结近20年来有关荜茇明碱的研究文献,总结其作用靶点,将明确的作用靶点提交到Cytoscape、Bingo等生物信息学分析软件中进行下一步文本挖掘,以预测其可能的生物学功能及相关靶基因。分析结果显示荜茇明碱对多种实体肿瘤及血液病均具有抑制作用,其作用机制主要包括血管生成转移、活性氧簇(ROS)、DNA损伤、诱导细胞凋亡、阻止细胞周期、逆转肿瘤细胞耐药6个方面。通过采用Cytoscape、Bingo等软件进行深入文献挖掘后发现,其抗肿瘤潜能主要涉及78个基因,包含4个主要的分子模块,其潜在靶基因指向可能与核酸变化以及细胞压力处理过程有关。以上分析结果将为荜茇明碱抗肿瘤作用的进一步研究提供新的研究方向。

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期刊信息
  • 《广州中医药大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广东省教育厅
  • 主办单位:广州中医药大学
  • 主编:陈蔚文
  • 地址:广州大学城外环东路232号
  • 邮编:510006
  • 邮箱:gzzyxb@gzucm.edu.cn
  • 电话:020-36585268
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-3213
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1425/R
  • 邮发代号:46-275
  • 获奖情况:
  • 国家期刊奖,国家“双效”期刊,荣获1999年全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国乌利希期刊指南,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:15723