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胡杨Na^+/H^+反向运输载体(PeNHX2)基因的克隆与序列分析
  • ISSN号:1004-311X
  • 期刊名称:《生物技术》
  • 时间:0
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]新疆大学生命科学与技术学院分子生物学重点实验室,新疆生物资源基因工程重点实验室,新疆乌鲁木齐830046
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30460015);教育部科学技术研究重点项目(205178)[Supported by National Natural Science Foundation of China(No.30460015)and Key Program Project of Ministry of Education(No.205178)]
中文摘要:

植物液泡膜上Na^+/H^+反向运输载体(Na^+/H^+ andiporter NHX)已被证明在盐胁迫中发挥关键作用,该研究旨在从胡杨中克隆获得耐盐相关的的完整cDNA序列,为进一步比较胡杨的耐盐基因的差异,探讨胡杨的耐盐分子机理奠定了基础,并为通过转基因手段提高木本植物的耐盐能力提供侯选基因。根据已发表MHX的同源基因序列,采用特异性引物扩增核心片段,并结合5’与3’RACE技术,成功地从胡杨(populus euphratica)克隆获得PeNHX2,其cDNA全长1638bp。测序和序列分析结果表明该基因与已发表毛白杨(Populus tomentosa)RtNHX基因在核酸水平及蛋白质水平上同源性均达到最高,依次为90.6%和88.25%。利用DNAMAN软件进一步分析得知,该基因与新疆盐生植物中所克隆获得的的犁苞滨藜(Atriplex dimorphostegia)AdNHX1、灰绿藜(Chenopodium glaucum)CgNHX1、盐爪爪(Kalidium foliatum)KfNHX同源性也较高,核酸水平上依次为75.1%、74.8%、74.3%,蛋白质水平依次为78.3%、79.0%、78.3%。PeNHX2与NCBI已注册的部分PeNHX1序列,在核酸或蛋白质水平同源性(72.34%和73.72%)均较低,分析它们可能同属于胡杨NHX基因家族,相关生物学功能有待于进一步研究。

英文摘要:

The Na^+/H^+ antiporter has been proved to play an important role in salt tolerance of plant. To further elucidate the mechanism of salt - tolerance of P. euphratica and provide the candidate gene to improve the salt tolerance of wood plants through transgenic technology in the future, A Na^+/H^+ Antiporter( named PeNHX2)were to be cloned. According to the published sequence of NHX, conservative sequence primers were designed, and combined with the technology of RACE, the full length cDNA sequence of PeNHX2 was gotten. The results of blasting this gene on NCBI showed that PeNHX2 had the highest homology with Populus tomentosa NttX (PtNHX). While the homology of PeNttX with other NHX genes of halophyfic plants in Xinjiang: Atriplex dimorphostegia NHX (AdNHX1), Chenopodium glaucum NHX ( CgNHX1 ), Kalidium foliatum NHX (KfNHX) on nucleotide level PeNHX2 were respectively 75.1%, 74.8 %, 74.3 % identity, and on protein level, the corresponding homologies were 78.3% ,79.0% ,78.3%. But PeNHX2 had relatively low identities with PeNHX1 published on NCBI, it may show that the two genes belong to the same gene family , but their functions in salt tolerance need to be further characterized.

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期刊信息
  • 《生物技术》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:黑龙江省科学院
  • 主办单位:黑龙江省科学院微生物研究所 黑龙江省微生物学会 黑龙江省生物工程学会
  • 主编:张介驰
  • 地址:哈尔滨市道里区兆麟街68号
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  • 国际标准刊号:ISSN:1004-311X
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1319/Q
  • 邮发代号:14-225
  • 获奖情况:
  • 中国生物学核心期刊,中国核心期刊(遴选)数据库...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:13503