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长江和闽江长体鳜遗传多样性的细胞色素b全序列分析
  • ISSN号:1004-874X
  • 期刊名称:《广东农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:Q346.5[生物学—遗传学]
  • 作者机构:[1]暨南大学生命科学学院,广东广州510632
  • 相关基金:国家自然科学基金(41071034);暨南大学科研创新基金(21611426,21613105)
中文摘要:

对长江水系中江西都昌和闽江水系中福建建瓯2个群体23尾长体鳜细胞色素b全基因的1 141 bp序列进行分析,发现15个变异位点,其中简约信息位点7个,共有13个单倍型,总体单倍型多样度(Hd)和核苷酸多态度(Pi)分别为0.933(±0.030)和0.00241(±0.030),呈现出高单倍型多样性和低核苷酸多样性的特点.中性检验结果显示Fu's Fs为显著负值,核苷酸不配对分析呈现单峰分布,表明长体鳜在历史上经历过种群扩张事件,推测扩张年代约为6万年前,为更新世晚期.在邻接树和简约性网络图中不同地理来源的单倍型交错分布,群体间的Fst和Nm值分别为0.06667和3.5.AMOVA分析表明,长体鳜群体内遗传差异(95.17%)大于群体间(4.83%)遗传差异,遗传变异主要是集中在群体内部,表明都昌和建瓯的长体鳜群体间没有出现明显遗传分化,可作为一个管理保护单位.

英文摘要:

1 141-bp sequence of mitochondrial DNA cytochrome b gene of 23 individuals from 2 populations of Siniperca roulei collected in Duchang of Yangtze River and Jianou of Minjiang River was sequenced. 15 variable sites including 7 parsimony informative sites defined 13 haplotypes, the global haplotype diversity (Hd) and nucleotide diversity (Pi) were 0.933 (± 0.030) and 0.00241 (±0.030) respectively, indicating a pattern of high haplotype diversity and low nueleotide diversity. The significant negative values of neutral test of Fu's Fs and the unimodal mismatch distribution pattern revealed a historical population expansion deduced at about 60 000 years ago. With the intertwined haplotypes of various geographic populations in Neighbor- joining and TCS tree, the Fst and Nm between two populations were 0.06667 and 3.5 respectively, 95.17% genetic variation occurred between populations was much higher than 4.83% genetic variation oecmxed in populations by AMOVA analysis, indicating that no obvious genetic differentiation was found and they could be protected as a single management unit.

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期刊信息
  • 《广东农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广东省农业科学院
  • 主办单位:广东省农业科学院 华南农业大学
  • 主编:
  • 地址:广州市天河区金颖路31号五山广东省农科院农经所
  • 邮编:510640
  • 邮箱:gdnykx@vip.163.com
  • 电话:020-38319948 38319941 38319942 38319946
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-874X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1267/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 广东省第二、第三届优秀科技期刊,广东省首届十佳期刊,中国期刊方阵“双效”期刊,第四届全国农业优秀期刊一等奖,第五届全车优秀农业期刊鑫犁奖一等奖,首届全国CAD规范一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:33995