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二斑叶螨不同发育时期基因组DNA甲基化的F-MSAP分析
  • ISSN号:2095-1353
  • 期刊名称:应用昆虫学报
  • 时间:2013
  • 页码:336-344
  • 分类:Q75[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]南京农业大学昆虫学系,南京210095
  • 相关基金:公益性行业(农业)科研专项“作物叶螨综合防控技术研究与示范推广(201103020)”和国家自然科学基金项目(31172131).
  • 相关项目:朱砂叶螨与二斑叶螨表观分化的分子机理研究
中文摘要:

DNA甲基化是表观遗传调控的重要机制,在真核生物基因表达调控中发挥重要作用。本研究通过荧光标记的甲基化敏感扩增多态性技术(F-MSAP,fluorescence-labeled methylation—sensitive amplified polymorphism)对二斑叶螨Tetranychus urticae Koch 4个龄期(卵、幼螨、若螨、成螨)基因组DNA中CCGG位点的胞嘧啶甲基化水平和模式进行分析。研究结果显示3种甲基化模式:无甲基化(TypeI),半甲基化(TypeⅡ),全甲基化(TypeⅢ)在4个龄期均有出现,扩增的总甲基化位点共有641个,其中半甲基化率(TypeⅡ)均高于全甲基化率(TypeⅢ),各个龄期的平均总甲基化率(TypeⅡ+TypeⅢ)为16.01%,平均半甲基化率为10.24%,平均全甲基化率为5.77%。F-MSAP分析结果表明不同发育时期的二斑叶螨基因组DNA的甲基化水平和模式存在差异。

英文摘要:

DNA methylation is a key mechanism underlying epigenetic regulation and plays a very important role in regulating gene expression. The level and pattern of cytosine methylation in genomic DNA CCGG sites of the four stages (egg, larva, nymph, adult) of Tetranychus urticae Koch were assessed using the Fluorescence-Labeled methylation- sensitive amplified polymorphism (F-MSAP) technique. The results indicate that all three types of methylation patterns (Type Ⅰ : unmethylated, Type Ⅱ: hemi-methylated, Type Ⅲ : full methylated) were observed in all four stages. The total number of amplification methylation sites was 641, in whieh the hemi-methylated ratio was higher than the full methylation ratio across all four stages. The average total methylated ratio (Type Ⅱ + Type Ⅲ), hemi-methylated methylated ratio (Type Ⅱ), and full methylation ratio ( Type Ⅲ) were 16.01% , 10.24% and 5.77% , respectively. The results of F-MSAP analysis demonstrate that the genomic DNA methylation level and pattern were different across the four different developmental stages of T. urticae.

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期刊信息
  • 《应用昆虫学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国昆虫学会 中国科学院动物研究所
  • 主编:戈峰
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院5号中科院动物所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:entom@ioz.ac.cn
  • 电话:010-64807137
  • 国际标准刊号:ISSN:2095-1353
  • 国内统一刊号:ISSN:11-6020/Q
  • 邮发代号:2-151
  • 获奖情况:
  • 96、2000年获中科院《优秀期刊三等奖》,92年获中国科协《优秀学术期刊一等奖》,2001进入“中国期刊”方阵,“双百”期刊,排名第96位
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:3170