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陆地棉转录因子的染色体定位
  • ISSN号:0496-3490
  • 期刊名称:作物学报
  • 时间:0
  • 页码:1361-1368
  • 分类:S512.1[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]西南大学农学与生物科技学院/南方山地农业教育部工程研究中心,重庆400716
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31071464,30900910);重庆市自然科学项目(CSTC,2010BB1013)资助
  • 相关项目:陆地棉第六染色体衣分和纤维品质性状QTL的精细定位
中文摘要:

利用植物转录因子PTFD数据库1116条陆地棉转录因子DNA序列设计的1455对SSR引物,筛选陆地棉品种/品系渝棉1号、中棉所35、7235和T586,获得66对多态性引物。它们涉及到27个转录因子家族的64个转录因子,其中渝棉1号与中棉所35间23对多态性引物,渝棉1号与T586间30对多态性引物,渝棉1号与7235间33对多态性引物。以多态性引物检测对应重组近交系群体,共获得93个位点。其中,(渝棉1号×中棉所35)群体23个位点,(渝棉1号×T586)群体32个位点,(渝棉1号×7235)群体38个位点。利用转录因子SSR位点与实验室已定位的SSR位点进行遗传连锁分析,将84个位点定位于23条染色体上,其中32个位点分布于A染色体组,52个位点分布于D染色体组。

英文摘要:

A total of 1 455 SSR primer pairs designed from 1 116 Gossypium hirsutum transcription factor DNA sequences in Plant Transcription Factor Databases(PTFD) were used to screen the polymorphic primers between upland cotton cultivars/lines Yumian 1,7235,CCRI35,and T586.A total of 66 pairs of polymorphic primers were obtained,which are related to 64 transcription factors among 27 transcription factor families.The polymorphic primers included 23 pairs between yumian1 and CCRI35,30 pairs between Yumian 1 and T586,and 33 pairs between Yumian 1 and 7235.Sixty-six polymorphic primer pairs were used to genotype the corresponding recombinant inbred line populations,and 93 loci were obtained,including 23 loci in population(Yumian 1×CCRI35) F2:6,32 loci in population(Yumian 1×T586) F2:7,and 38 loci in population(Yumian 1×7235) F2:6.The transcription factor SSR loci,together with other SSR loci which have already been mapped on upland cotton linkage map in our laboratory,were used to conduct genetic linkage analysis,and 84 loci were mapped on 23 chromosomes,including 32 loci on A genome and 52 on D genome.

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期刊信息
  • 《作物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国作物学会 中国农业科学院作物科学研究所
  • 主编:万建民
  • 地址:北京海淀区中关村南大街12号中国农业科学院
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zwxb301@caas.cn
  • 电话:010-82108548
  • 国际标准刊号:ISSN:0496-3490
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1809/S
  • 邮发代号:82-336
  • 获奖情况:
  • 2002年-第三届中国科协优秀科技期刊二等奖,2002-2009年-百种中国杰出学术期刊,2004年获“全国优秀期刊一等奖”,2005年获第三届国家期刊奖提名奖,2009年评为“2008年度中国精品科技期刊”,2009年被评为“新中国60年有影响力的期刊”,2011年获"第二届中国出版政府奖期刊奖提名奖"
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:49369