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甘草紫杉烯5α-羟化酶cDNA的生物信息学分析
  • ISSN号:1007-1865
  • 期刊名称:广东化工
  • 时间:2014
  • 页码:28-29+36
  • 分类:TQ[化学工程]
  • 作者机构:[1]广东药学院中药学院,广东广州510006, [2]中国中医科学院中药资源中心,北京100700, [3]道地药材国家重点实验室,北京100700
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(81173488),中医药行业科研专项(201207002),中国中医科学院中药研究所自主选题项目(2011ZDXK-01),中国中医科学院中药资源中心开放基金项目(KFKT2013005),广东省中医药局科研项目“茉莉酸甲酯对干旱胁迫调控甘草次级代谢的作用机制研究”
  • 相关项目:适度干旱胁迫促进甘草有效成分积累的分子机制解析
中文摘要:

[目的]分析甘草紫杉烯5α-羟化酶(GuT5H)cDNA序列及其编码的蛋白质的结构特征.[方法]以甘草GuT5H全长cDNA为研究对象,运用生物信息学软件和网络工具预测其编码的蛋白质序列,并分析该蛋白质的结构、功能及分子进化特征.[结果]甘草GuT5H cDNA全长1692 bp,含有1428 bp的开放阅读框,编码475个氢基酸残基的蛋白质;该蛋白质与细胞色素P450家族紫杉烯5αt-羟化酶(T5H)成员具有高度的序列一致性,分子进化上与同科植物大豆、苜蓿、鹰嘴豆的T5H关系最为密切.[结论]甘草GuT5H cDNA编码紫杉烯5α-羟化酶,属于细胞色素P450家族成员.

英文摘要:

[Objective] To analyze the structure characteristics of a taxadiene 5α-hydroxylase cDNA (GuTGH) and the deduced amino acid sequence in Glycyrrhiza uralensis. [Methods] The completed cDNA sequence and the structure, function, phylogeny of the deduced amino acid sequence of GuT5H were predicted by bioinformatics analysis. [Results] The cDNA sequence of GuT5H was 1692 bp with an open reading frame of 1428 bp, encoding a protein of 475 amino acid residues. The GuT5H protein has a high sequence identity with other taxadiene 5α-hydroxylases (T5H) which belong to the cytochrome P450 family. Phylogenetically, GuT5H was closely related with T5Hs in Glycine max, Medicago truncatula, Cicer arietinum and other Leguminosae plants. [Conclusion] GuT5H cDNA encode a protein of taxadiene 5α-hydroxylase, which belong to the cytochrome P450 family.

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期刊信息
  • 《广东化工》
  • 主管单位:广东省广业科技集团有限公司
  • 主办单位:广东省石油化工研究院
  • 主编:邹思民
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  • 电话:020-83302517
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-1865
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1238/TQ
  • 邮发代号:46-211
  • 获奖情况:
  • 多年来多次获原化工部及现中国化工行业协会、广东...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版)
  • 被引量:25903