位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
文蛤(Meretrix meretrix)C-型凝集素基因的分子克隆及表达分析
  • ISSN号:0029-814X
  • 期刊名称:《海洋与湖沼》
  • 时间:0
  • 分类:S917[农业科学—水产科学]
  • 作者机构:[1]宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室,宁波315211
  • 相关基金:教育部长江学者与创新团队项目,IRT0734号; 浙江省海水养殖重点科技创新团队项目,2010R50025-08号; 宁波市水产病害防控与安全科技创新团队项目,2013B82012号
中文摘要:

C-型凝集素是一种重要的模式识别蛋白,本研究以文蛤为材料。利用PCR扩增和RACE技术首次获得了编码文蛤C-型凝集素的基因(Mm-CTL)c DNA序列,全长为1855bp,其开放阅读框为519bp,编码172个氨基酸。Smart软件预测Mm-CTL的糖识别结构域(CRD)从第34个氨基酸到第168个氨基酸。BLASTP序列相似性分析显示,Mm-CTL与大竹蛏氨基酸序列同源性最高,相似性为56.5%,与其它无脊椎动物的相似性为13.5%—23.9%。系统进化树分析与同源分析结果一致,其中Mm-CTL与双壳类C-型凝集素聚在一起,与大竹蛏亲缘性最近。环境胁迫实验显示,溶藻弧菌感染6h时Mm-CTL表达量明显上升,在12h时达到最高值,随后有所下降。盐度胁迫时Mm-CTL在盐度5时表达量相对较低,在盐度10—20中的表达量相对较高。温度胁迫时Mm-CTL在35°C时表达量相对最高,10°C时表达量明显较低。研究结果表明,文蛤应对环境因子影响可通过调节Mm-CTL的表达来应答免疫反应。本研究将为贝类先天性免疫因子研究以及病害的防控奠定基础。

英文摘要:

The C-type lectin is one of the most important pattern recognition receptors. In present study, a C-type lectin was cloned from Meretrix meretrix(Mm-CTL) for the first time using degenerated PCR and rapid amplification of complementary DNA ends(RACE) method. The full length of the Mm-CTL c DNA was 1855 bp containing a 519-bp open reading frame(ORF) encoding a 172-amino-acid polypeptide. Prediction of protein domains revealed that the Mm-CTL contain a typical carbohydrate recognition domain(CRD) that ranged 34 th to 168 th amino acid. BLASTP analysis showed that the Mm-CTL shared 56.5% identity with the ortholog in Solen grandis, and 13.5%—23.9% with other invertebrate orthologs. Mm-CTL is distinctly clustered with mollusk as expected in phylogenetic analysis. After Vibrio alginolyticus challenge, the Mm-CTL m RNA was induced significantly in 6h post challenge, and its expression peaked in 12 h. Moreover, the Mm-CTL expression reduced in salinity 5 compared to that in salinity 10—20. In a thermal stress, the Mm-CTL expression was down-regulated at 10°C, whilst increased at 35°C. Therefore, the expression of Mm-CTL might response to bacterial infections or environmental stress. The findings may help understanding innate immune factor in molluscs for disease prevention.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《海洋与湖沼》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国海洋湖沼学会
  • 主编:孙松
  • 地址:青岛市南海路7号中科院海洋所内
  • 邮编:266071
  • 邮箱:
  • 电话:0532-82898753
  • 国际标准刊号:ISSN:0029-814X
  • 国内统一刊号:ISSN:37-1149/P
  • 邮发代号:2-421
  • 获奖情况:
  • 2000年中国科学院优秀期刊一等奖,2000年山东省科委、新闻出版黑署评估优秀级,中国期刊方阵“双百”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21021