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猪IFN-β和IRF-3基因实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立
  • ISSN号:1004-3268
  • 期刊名称:《河南农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S828[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]郑州大学生物工程系,河南郑州450001, [2]河南省农业科学院农业部动物免疫学重点开放实验室/河南省动物免疫学重点实验室,河南郑州450002
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30730068); 河南省重大科技攻关计划项目(082101510002)
中文摘要:

为建立猪IFN-β及IRF-3基因实时荧光定量PCR检测方法,依据GenBank中IFN-β和IRF-3基因的保守序列,设计并合成各自特异性引物,并以β-actin为内参基因,采用SYBR Green-Ⅰ为染料,建立实时荧光定量检测方法。提取猪肺泡巨噬细胞总RNA,经反转录得cDNA,用特异性引物经PCR扩增得到IFN-β和IRF-3基因,将其克隆至pMD-19T载体,经测序鉴定后得重组质粒,依次10倍稀释做为标准品,建立标准曲线及溶解曲线。结果表明,β-actin基因、IFN-β基因和IRF-3基因标准曲线线性关系较好,R2≥0.997;溶解曲线为特异性单峰,无非特异性扩增,检测下限可达100个拷贝/μL。建立的猪IFN-β和IRF-3基因实时荧光定量RT-PCR检测方法,特异性强、重复性好,为从分子水平上研究猪的免疫应答奠定了基础。

英文摘要:

To establish real-time fluorescent quantitative RT-PCR assays for detecting porcine IFN-β and IRF-3,sevral specific primer pairs were designed according to the porcine's IFN-β and IRF-3 gene sequences available in GenBank,and the porcine β-actin gene was used as an internal gene control.The total RNA was extracted from porcine alveolar macrophages.The reverse transcriptase PCR was used to obtain the first strand cDNA.Fragments for IFN-β and IRF-3 were amplified by PCR from the synthesized cDNA using the designed specific primers.The PCR products were purified and cloned into pMD-19T vector.The positive recombined plasmids were serially diluted and used as a standard.The standard and melting curve was analyzed.The results showed that the Ct value of β-actin,IFN-β and IRF-3 genes had a good linear relationship(R2≥0.997) and the melting curve showed a single peak.The established real-time PCR methods can detect 100 copies of IFN-β and IRF-3 mRNA.The developed real-time PCR using SYBR GreenⅠdye had high sensitivity,sepcifity and reproductivity,and could used as an effective tool for detection and quantification of IFN-β and IRF-3.

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期刊信息
  • 《河南农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:河南省农业科学院
  • 主办单位:河南省农业科学院
  • 主编:张新友
  • 地址:郑州市花园路116号
  • 邮编:450002
  • 邮箱:hnnykx@163.com
  • 电话:0371-65739041
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-3268
  • 国内统一刊号:ISSN:41-1092/S
  • 邮发代号:36-32
  • 获奖情况:
  • 全国中文核心期刊,全国农业优秀期刊,连续四届被评为河南省优秀期刊...,全国期刊方阵双效期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 英国农业与生物科学研究中心文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:27029