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Wistar大鼠c-ski基因部分序列的克隆、测序及实时荧光定量PCR的建立
  • ISSN号:0577-7402
  • 期刊名称:《解放军医学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R349.8[医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]第三军医大学大坪医院野战外科研究所分子生物学中心,创伤、烧伤与复合伤国家重点实验室,重庆400042
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30801195);国家重点基础研究发展计划(973计划)资助项目(G1999054205,2005cb522602)
中文摘要:

目的测定Wistar大鼠c-ski基因部分序列,并应用于检测大鼠c-ski基因表达的实时荧光定量PCR的建立。方法提取培养的Wistar大鼠皮肤成纤维细胞总RNA,通过RT-PCR扩增,将扩增产物克隆到PMD-18T载体上并测序。根据获得的c-ski基因部分序列设计实时荧光定量PCR引物,建立SYBRgreen定量PCR检测方法,并检测培养的大鼠皮肤成纤维细胞c-skimRNA表达水平。结果获得的Wistar大鼠c-ski基因cDNA序列长561bp,为未曾报道的新序列,其与人、小鼠具有较高的同源性,Gen-Bank收录(收入号DQ409171)。建立的SYBRgreen定量PCR检测标准品在10^3~10^9拷贝范围内的相关系数为0.99149。体外培养的Wistar大鼠皮肤成纤维细胞样品中c-skimRNA水平为(1.02±0.18)×10^6拷贝/μl。结论新获得了Wistar大鼠c-ski基因部分序列,该序列可用于实时荧光定量PCR的建立。

英文摘要:

Objective To clone and analyze the partial c-ski gene of Wistar rat,and to develop SYBR Green-based real-time fluorescence quantitative PCR.Methods Total RNA was extracted from the cultured skin fibroblasts of Wistar rat,the partial c-ski gene was then amplified by reverse transcription polymerase chain reaction(RT-PCR) and cloned into eukaryotic expression vector PMD-18 T,then sequenced with Beckman CEQTM8000.The new partial sequence was used to design the oligodoxynucleotide primers,and the real-time quantitative fluorescence PCR was based on SYBR Green,which was obtained to examine the expression of c-ski mRNA in samples of the cultured skin fibroblasts of Wistar rat.Results The partial c-ski gene of Wistar rat obtained by RT-PCR and cloned into eukaryotic expression vector PMD-18 T was 561 bp in length,and shared high homology with that of human and mouse,and accepted by GenBank as new sequence(ACCESSION DQ409171).The established real-time PCR showed high correlations(r=0.99149) with the standard curves from 10%3 to 10^9 copies.Conclusion The SYBR Green based real-time fluorescence PCR has been established successfully and can be used for determination of c-ski mRNA of skin tissue and cultured cells.

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期刊信息
  • 《解放军医学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国人民解放军总后勤部卫生部
  • 主办单位:人民军医出版社
  • 主编:
  • 地址:北京市100036信箱188分箱
  • 邮编:100036
  • 邮箱:mjcpla@pmmp.com.cn
  • 电话:010-51927306
  • 国际标准刊号:ISSN:0577-7402
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1056/R
  • 邮发代号:2-74
  • 获奖情况:
  • 全军医学期刊质量评比优秀期刊奖,北京市全优期刊奖,中国科学引文数据库来源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:30614