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基于叶绿体微卫星研究鄂报春谱系遗传结构
  • ISSN号:1674-4918
  • 期刊名称:《植物分类学报:英文版》
  • 时间:0
  • 分类:Q987[生物学—遗传学;生物学—人类学]
  • 作者机构:[1]中国科学院华南植物园,广州510650, [2]中研院生物多样性研究中心,台北115, [3]华南农业大学生命科学学院,广州510642, [4]中国科学院研究生院,北京100049
  • 相关基金:Supported by the National Natural Science Foundation of China, Grant Nos. 30470125, 40671066, and the Knowledge Innovation Project of Chinese Academy of Sciences, Grant No. KSCX2-SW- 132.
中文摘要:

鄂报春Primula obconica作为一种广泛栽培的园艺植物,其野生居群的遗传多样性及遗传结构的研究还少见报道。本文通过叶绿体微卫星分析了17个鄂报春野生居群(共278个个体),共发现4个多态性位点(16个等位基因),得到14个单倍型。结果表明鄂报春具有很高的总基因多样性(HT=0.971)和极低的居群内基因多样性(HS=0.028);分子方差分析(AMOVA)显示98%的变异存在于居群间。这些结果说明早期的生境片断化及有限的种子传播能力是造成当前遗传结构的重要原因。Nst值显著大于Gst值,表明关系相近的单倍型会出现在相同的地区内,同时最小生成树(MST)的分析结果证实了这样的结论。我们在最小生成树的两个组中推断出一些古老单倍型,并推测在冰期时湖北和我国的西南地区可能是该物种的避难所。

英文摘要:

Primula obconica has been cultivated widely as a popular garden plant. In order to discover the pattern of genetic diversity and the evolutionary process, a total of 278 individuals from 17 populations throughout its distribution in China were analyzed using chloroplast microsatellites (cpSSRs) markers. Four loci and a total of 14 haplotypes were identified by our data set. The total gene diversity (HT =0.971) is high, while gene diversity within populations (HS=0.028) is low. Analysis of molecular variance (AMOVA) shows that about 98% variation is among populations. The results suggest that past fragmentation and limited dispersal ability of seeds might play important roles in forming the present genetic structure. A significantly higher value of Nst than that of Gst indicates that closely related haplotypes are often found in the same area, and we found two different groups in the minimum spanning tree (MST), which occupy different geographic regions. Furthermore, older haplotypes were detected in the two groups, respectively. Possible refugia are inferred in western Hubei Province and SW China during the glacial period.

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期刊信息
  • 《植物分类学报:英文版》
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院植物研究所 中国植物学会
  • 主编:陈之端 仇寅龙
  • 地址:北京香山南辛村20号
  • 邮编:100093
  • 邮箱:jse@ibcas.ac.cn
  • 电话:010-62836572 62836132
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-4918
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5779/Q
  • 邮发代号:2-226
  • 获奖情况:
  • 2001年 中国期刊方阵“双百期刊” 中国新闻出版总...,2000年 中国科学院优秀期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库
  • 被引量:30